鯔魚雌雄基因組DNA差異分析及性腺發(fā)育相關功能基因的克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究利用RAPD和AFLP分子標記技術,對雌雄鯔魚基因組DNA的差異性進行了探討和分析,尋找其性別特異性DNA分子標記。同時利用PCR方法從性腺中克隆了兩個與性腺發(fā)育相關的功能基因—P450芳香化酶基因和piwi相關基因的cDNA片段,為探討其性腺分化發(fā)育的機制打下基礎。首先利用400條RAPD隨機引物對雌雄鯔魚的基因組DNA進行初步篩選,得到了雌性特異序列S226和雄性性別特異序列S60。對這兩條性別相關的差異序列進行驗證后,認為它

2、們不是與性別相關的具有穩(wěn)定性和可遺傳性的性別特異性探針。利用64對AFLP引物對雌雄鯔魚的基因組DNA進行了差異性分析,得到了三條性別相關的序列:M5,M47,M47。但是經(jīng)過進一步的驗證后,排除了其為性別特異性探針的可能性。以鯔魚卵巢cDNA為模板,用PCR的方法克隆得到了P450aromA的1543bp的cDNA序列,同時也克隆到了piwi相關基因的1237bp的cDNA序列。將P450aromA的cDNA序列進行翻譯,可推導出43

3、4個氨基酸,并且cDNA序列含有236bp的3’非編碼區(qū),在poly(A)前18bp處存在AGTAAA加尾信號。鯔魚piwi相關基因的cDNA序列可推導出412個氨基酸,利用DNAstar與人、小鼠、果蠅、線蟲和斑馬魚的piwi的氨基酸序列進行同源性分析,發(fā)現(xiàn)鯔魚PIWI與斑馬魚的PIWI的同源性最高,為75.5%;與人、小鼠、果蠅和線蟲的同源性較低,在30.5%-58.8%之間。進化樹分析也表明鯔魚的piwi相關基因與斑馬魚的ziwi

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