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文檔簡介
1、背景:
長鏈非編碼RNA(LncRNAs)是參與多種生物功能普遍存在的一類重要基因,它可以作為參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵共活化因子。眾所周知,白色脂肪的功能是貯存能量而棕色脂肪是消耗能量。白色和棕色脂肪細胞均起源于中胚層。然而,目前尚不清楚LncRNAs是否在棕色脂肪和白色脂肪的能量代謝和成脂分化中起到作用。
目的:
研究LncRNAs在棕色和白色脂肪中表達譜的差異特征,明確LncRNAs是否參與棕色脂肪和白色脂肪
2、的能量代謝和成脂分化這一生物過程。為今后在治療肥胖提供了理論基礎(chǔ)。
方法:
首先,采用免疫組化法來鑒別棕色脂肪,隨后分別提取棕色脂肪和白色脂肪的總RNA并對總RNA的質(zhì)量鑒定;采用實時熒光定量PCR,對這些差異倍數(shù)大的LncRNAs進行驗證;為了揭示這些LncRNAs的潛在功能,通過GO和Pathway分析方法,對這些表達差異的LncRNAs進行了分析,并且通過斯皮爾曼相關(guān)分析和生物信息學(xué)分析對基因AK142386和
3、AK133540的潛在相關(guān)靶基因進行了預(yù)測;
結(jié)果:
解偶聯(lián)蛋白-1(uncoupling protein-1 UCP-1)免疫組化顯示陽性著色較深的為棕色脂肪組織;利用第二代測序技術(shù)和芯片技術(shù),通過比較棕色脂肪組織和白色脂肪組織分化相關(guān)LncRNA表達譜特征,發(fā)現(xiàn)了735個上調(diào)和877個下調(diào)的LncRNA(差異倍數(shù)大于4)。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示所挑選出的基因差異性表達符合芯片結(jié)果;GO和Pathway分析,發(fā)
4、現(xiàn)了AK142386和AK133540影響了脂肪生成和能量代謝;斯皮爾曼和生物信息學(xué)分析,Hoxa3和Acad10分別是基因AK142386和AK133540的相關(guān)靶基因,推測可能通過其影響能量代謝。
結(jié)論:
通過實驗驗證和生物信息學(xué)的方法,分析了棕色脂肪和白色脂肪LncRNA的差異表達譜特征,也證實本研究芯片數(shù)據(jù)有較高的可重復(fù)性,總之通過芯片結(jié)果已經(jīng)確定了大量的LncRNAs,這些LncRNAs在脂肪形成和能量代謝
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