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1、目的:使用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),探討過表達(dá)腫瘤抑制基因CADM1以及IGF-1R阻滯劑PPP對(duì)人骨肉瘤U-2OS細(xì)胞株起抑癌作用的差異蛋白,為進(jìn)一步蛋白質(zhì)芯片制作、蛋白質(zhì)間相互作用、新藥設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn)研究提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
方法:實(shí)驗(yàn)分過表達(dá)CADM1組與轉(zhuǎn)染空載體組和PPP實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組。
1.過表達(dá)CADM1組與轉(zhuǎn)染空載體組:取過表達(dá)CADM1的人骨肉瘤U-2OS-CADM1細(xì)胞株(課題組公開專利201510924952.
2、7,中國典型培養(yǎng)物保藏中心保藏編號(hào):CCTCC NO:C201518)及轉(zhuǎn)染空載體人骨肉瘤U-2OS細(xì)胞株進(jìn)行細(xì)胞復(fù)蘇、擴(kuò)增培養(yǎng),提取細(xì)胞總蛋白,運(yùn)用雙向電泳技術(shù)鑒定出其中的差異蛋白,并查閱相關(guān)數(shù)據(jù)庫和資料,進(jìn)行對(duì)比分析。
2. PPP實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組:取人骨肉瘤U-2OS細(xì)胞株進(jìn)行細(xì)胞復(fù)蘇、擴(kuò)增培養(yǎng)。PPP組加入PPP8.0μM(DMSO溶解),對(duì)照組加入等量DMSO,提取細(xì)胞總蛋白質(zhì),運(yùn)用雙向電泳技術(shù)鑒定出其中的差異蛋白,并
3、進(jìn)行質(zhì)譜分析及查閱相關(guān)數(shù)據(jù)庫和資料,進(jìn)行對(duì)比分析。
結(jié)果:1.過表達(dá)CADM1組與轉(zhuǎn)染空載體組細(xì)胞總蛋白,重復(fù)3次進(jìn)行雙向電泳實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)有效分離了細(xì)胞總蛋白,凝膠圖譜背景低,蛋白點(diǎn)清晰可見。雙向電泳實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見蛋白質(zhì)點(diǎn)894±19個(gè),與空載體對(duì)照株比較,U-2os-CADM1細(xì)胞株有23個(gè)蛋白點(diǎn)表達(dá)顯著上調(diào),21個(gè)蛋白點(diǎn)表達(dá)顯著下調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。實(shí)驗(yàn)選取了其中12個(gè)顯著性差異表達(dá)的蛋白位點(diǎn)進(jìn)行了質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)分
4、析,其中被成功檢測(cè)的蛋白位點(diǎn)有6個(gè),分別是:乳酸脫氫酶B鏈(LDHB)、α-烯醇化酶(ENOA)、半乳糖激酶(GALK1)、Ⅱ型細(xì)胞骨架1角蛋白(K2C1)、人組氨酸磷酸酶蛋白(PHP14)、Ⅰ型細(xì)胞骨架9角蛋白(K1C9)。
2. PPP實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組細(xì)胞總蛋白,重復(fù)3次進(jìn)行雙向電泳實(shí)驗(yàn),有效分離了細(xì)胞總蛋白,凝膠圖譜背景低,蛋白點(diǎn)清晰可見。雙向電泳實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見蛋白質(zhì)點(diǎn)795±23個(gè),與對(duì)照組比較,PPP組有25個(gè)蛋白點(diǎn)表達(dá)
5、顯著上調(diào),30個(gè)蛋白點(diǎn)表達(dá)顯著下調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。實(shí)驗(yàn)選取了其中12個(gè)顯著性差異表達(dá)的蛋白位點(diǎn)進(jìn)行了質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)分析,其中被成功檢測(cè)的蛋白位點(diǎn)有6個(gè),分別是:巨噬細(xì)胞移動(dòng)抑制因子(MIF)、D型多巴色素脫羧酶(DDT)、Ⅱ型細(xì)胞骨架1角蛋白(K2C1)、可溶抗藥性相關(guān)鈣結(jié)合蛋白(SRI)、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GSTP1)、黃素還原酶(BLVRB)。
結(jié)論:1.實(shí)驗(yàn)成功運(yùn)用雙向電泳、質(zhì)譜分析等蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)成功分
6、離并鑒定:乳酸脫氫酶B鏈(LDHB)、α-烯醇化酶(ENOA)、半乳糖激酶(GALK1)、Ⅱ型細(xì)胞骨架1角蛋白(K2C1)、人組氨酸磷酸酶蛋白(PHP14)、Ⅰ型細(xì)胞骨架9角蛋白(K1C9)6種蛋白在過表達(dá)CADM1組表達(dá)顯著差異,并檢索相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行分析。
2.實(shí)驗(yàn)成功運(yùn)用雙向電泳、質(zhì)譜分析等蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)成功分離并鑒定:巨噬細(xì)胞移動(dòng)抑制因子(MIF)、D型多巴色素脫羧酶(DDT)、Ⅱ型細(xì)胞骨架1角蛋白(K2C1)、可溶抗藥性
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