丹參抗心血管疾病有效成分的虛擬篩選研究.pdf

1、中國的傳統(tǒng)中藥作為中華五千年文明的一大瑰寶，數(shù)千年來積累了豐富的臨床醫(yī)學經(jīng)驗，在人類醫(yī)學的發(fā)展史上占有舉足輕重的地位。中藥的活性成分以及藥效作用機理是中藥現(xiàn)代化研究的重要組成部分。利用計算機輔助藥物設計理論研究中藥中活性成分的藥理作用，對于闡明中藥多組分多靶點協(xié)同作用的機理，乃至對于中藥現(xiàn)代化的進展都有重要的意義。在本實驗中，我們利用分子對接方法對中草藥丹參抗心血管疾病的有效成分進行了虛擬篩選，并對其藥理作用進行了初步研究。
　　

2、 使用Accelrys公司開發(fā)的Cerius2軟件包，結合化學信息學方法對查到的中草藥丹參中所含143個化合物進行了系統(tǒng)的研究。通過計算所有分子的特征描述符，分析了丹參中所含分子的化學空間，并與112個治療心血管疾病的藥物類藥分子進行比較，為更加直觀的分析兩類分子在化學空間上的分布，我們利用主成分分析法將兩類分子的化學空間映射到了二維空間上，結果顯示在化學空間分布上除了有個別離群點外，兩類分子有較大的重疊，這就說明丹參中很可能含有能夠

3、治療心血管疾病的化合物，為我們下一步的篩選提供了依據(jù)。
　　 利用分子對接方法我們研究了這143個分子與治療心血管疾病有關的23個靶標蛋白（37個結合位點）的相互作用，其中有20個分子與8個以上的活性位點有較好的相互作用，這一點充分驗證了丹參在抗心血管疾病方面并不是作用于單一靶點而是作用在多個靶點上，這也說明了中藥多組分多靶點協(xié)同作用的藥效機理。我們還統(tǒng)計了對接得分在前20位的分子，其中有9個分子與20個以上的活性位點有較好的相