蝴蝶蘭屬EST-SSR標記在蘭屬中的通用性研究.pdf

1、EST-SSR標記是近年來發(fā)展的基于表達序列標簽數據庫的一種新型分子標記。廣泛地應用在遺傳多樣性分析、親緣關系鑒定、遺傳圖譜的構建、比較基因組學等方面。研究 EST-SSR標記在物種間的通用性，可以減少引物開發(fā)成本，進而更好地應用于物種的遺傳育種工作。蘭屬植物在我國栽培歷史悠久，具有極高的觀賞價值，而國蘭的育種工作還主要停留在對野生種的選育上，品種改良進展緩慢，人工育種工作開展較少。目前，在NCBI上登錄了8845條蝴蝶蘭屬EST序列，

2、資源很豐富，利用蝴蝶蘭屬EST資源，探索蝴蝶蘭屬EST-SSR標記在蘭屬上的通用性，加速開發(fā)物種間的有效 EST-SSR標記，為蘭屬的遺傳育種、品種鑒定等奠定基礎工作。本研究根據已有報道，選取136對蝴蝶蘭 EST-SSR引物，分別用23個春蘭，11個蕙蘭，10個建蘭，10個寒蘭和10個墨蘭品種基因組DNA作模板，進行 PCR擴增和擴增產物的多態(tài)性分析，取得的結果如下：
　　（1）136對蝴蝶蘭EST-SSR引物，在供試的春蘭、蕙

3、蘭、建蘭、寒蘭、墨蘭中，分別有20、23、21、12、15對擴增出預期產物；有10、12、10、9、7對引物分別在春蘭、蕙蘭、建蘭、寒蘭、墨蘭中擴增產物顯示多態(tài)性。
　　（2）選用有多態(tài)性的引物對五大類國蘭品種進行 PCR擴增，有4對 EST-SSR引物在五大類國蘭品種間均有多態(tài)性，這4對引物在64個國蘭品種上共檢測出26個等位基因，每對引物檢測到的等位變異數目4~9個，平均6.5個；SSR引物多態(tài)性信息量(PIC)變化范圍為0.

4、210~0.527，平均為0.398。
　?。?）利用這4對EST-SSR引物對64份蘭屬品種進行UPGMA聚類分析，結果表明：64個國蘭品種間的遺傳相似系數在0.520~0.980之間，在遺傳相似系數為0.74時，64個國蘭品種可以分為四大類，第一大類（Ⅰ類），共34個材料，又可分為兩大亞類：一類（A類）主要為春蘭品種，另一類（B類）主要是蕙蘭品種。第二大類（Ⅱ類），共有13個材料，其中10個建蘭品種，3個寒蘭品種。第三大類（Ⅲ