砷暴露致肝纖維化系統(tǒng)評(píng)價(jià)及差異蛋白組學(xué)分析.pdf

1、目的：運(yùn)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法和統(tǒng)計(jì)學(xué)原理，對(duì)2005~2016年國內(nèi)外公開發(fā)表的主題為“砷致病機(jī)制”的文獻(xiàn)進(jìn)行定量和定性分析，以揭示國內(nèi)外砷致病機(jī)制的研究現(xiàn)狀、熱點(diǎn)與發(fā)展趨勢(shì)；以人群流行病學(xué)調(diào)查資料為基礎(chǔ)，運(yùn)用meta分析的方法評(píng)價(jià)砷暴露與肝纖維化的關(guān)系；運(yùn)用8標(biāo)同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric tags for relative and absolute quantification， iTRAQ)技術(shù)結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(

2、2DLc-MS/MS)技術(shù)篩選出砷致肝纖維化大鼠肝臟中的差異蛋白，并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析，為進(jìn)一步闡明砷致肝纖維化的作用機(jī)制提供資料。
　　方法：運(yùn)用文獻(xiàn)管理軟件ENDNOTE對(duì)2005~2016年國內(nèi)外公開發(fā)表的主題為“砷致病機(jī)制”的文獻(xiàn)進(jìn)行發(fā)表年份和來源期刊的分析，再使用信息可視化軟件CiteSpace對(duì)Web of ScienceTM核心合集和CNKI核心期刊專輯中同一時(shí)間段中該研究領(lǐng)域的文獻(xiàn)進(jìn)行共引、共現(xiàn)、共詞、聚類分析

3、。計(jì)算機(jī)檢索CNKI全文數(shù)據(jù)庫、萬方全文數(shù)據(jù)庫、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫、PubMed數(shù)據(jù)庫、web of science全庫、 EMBASE數(shù)據(jù)庫，檢索詞為砷暴露和肝纖維化，檢索時(shí)間從建庫至2016年12月31日，按照納入和排除標(biāo)準(zhǔn)篩選文獻(xiàn)，提取資料并評(píng)價(jià)納入文獻(xiàn)的質(zhì)量，采用Stata12.0軟件進(jìn)行mata分析，計(jì)算合并OR值和95％CI值，并進(jìn)行敏感性分析和發(fā)表偏倚評(píng)估。建立亞砷酸鈉致肝纖維化大鼠模型，運(yùn)用8標(biāo)iTRAQ

4、技術(shù)結(jié)合2DLc-MS/MS技術(shù)篩選差異蛋白，將差異蛋白放入U(xiǎn)niprot和STRING10.0，查看其代表的基因、功能和參與的通路，再用Goanna軟件分析差異蛋白參與的生物過程、所在的細(xì)胞位置和分子功能，在GO注釋分析的基礎(chǔ)上，用R軟件對(duì)差異蛋白參與的生物學(xué)過程進(jìn)行聚類分析，篩選出主要作用通路。
　　結(jié)果：1、從年發(fā)文量來看，國內(nèi)外砷致病機(jī)制研究的發(fā)展比較均衡，期間有小幅波動(dòng)，年均發(fā)文量227-260篇，但從2013年開始該研

5、究領(lǐng)域發(fā)表的文獻(xiàn)數(shù)量呈下降趨勢(shì)。2、國內(nèi)外文獻(xiàn)發(fā)表數(shù)量大于10的期刊均為核心期刊，國外來源期刊中93%JCR分區(qū)分布在Q1、Q2，37%期刊的影響因子大于5，研究領(lǐng)域主要集中在藥理學(xué)、毒理學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)等領(lǐng)域。3、結(jié)合H指數(shù)和高被引結(jié)果分析，在砷致病機(jī)制研究領(lǐng)域?qū)W術(shù)成就排名前四的作者為Styblo Miroslav、Vahter Marie、Thomas DanielJ、Aposhian HV；起到關(guān)鍵作用排名前三位的作者為Y

6、amanaka K、Anonymous和Mass MJ；既是經(jīng)典文獻(xiàn)又是關(guān)鍵文獻(xiàn)的論文是 A new metabolic pathway of arsenite:arsenic-glutathione complexes are substrates for human arsenic methyltransferase Cyt19和Trivalent arsenicals are bound to proteins during re

7、ductive methylation。4、合作發(fā)文量前三的國外作者為Naranmandura, Hua，Suzuki, Kazuo T和Waalkes, Michael P，合作發(fā)文量前三的國家為美國、中國和日本，合作密切程度前三的國家為美國、加拿大和德國；機(jī)構(gòu)中亞利桑那大學(xué)研究成果最多。國內(nèi)合著發(fā)文量前三的作者為鄭玉建、王績(jī)英和吳君，合著研究成果第一的機(jī)構(gòu)是貴陽醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院感染科。5、國外砷致病機(jī)制的研究熱點(diǎn)為毒性、氧化應(yīng)激、甲基

8、化、細(xì)胞轉(zhuǎn)化、三氧化二砷、信號(hào)通路、谷胱甘肽以及蛋白機(jī)制研究，國內(nèi)該領(lǐng)域研究熱點(diǎn)為三氧化二砷、細(xì)胞凋亡、亞砷酸鈉、砷中毒機(jī)制研究。6、無機(jī)砷、表達(dá)、去甲基化酸、膀胱癌、砷甲基化是砷致病機(jī)制研究領(lǐng)域不同時(shí)間段的研究前沿。7、砷致病機(jī)制研究主題為三氧化二砷，甲基化，攝入方式、劑量等6項(xiàng)。8、對(duì)砷暴露與肝纖維化關(guān)系進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)價(jià)發(fā)現(xiàn)，異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果χ2=9.27，P=0.234(>0.10)，I2=24.5%(<50%)。Z=8.42，P<0.

9、01，砷暴露與非砷暴露肝纖維化發(fā)生有差異，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果合并OR值為3.50，95％CI為2.615-4.685，即砷暴露地區(qū)的肝纖維化發(fā)病是非砷暴露地區(qū)的3.5倍。9、研究發(fā)現(xiàn)Hic-5蛋白、谷胱甘肽合成酶在中、高劑量染毒組均上調(diào)，原肌球蛋白共有六種蛋白，其中Tmp2在中、高劑量染毒組下調(diào)，其他五種均顯示上調(diào)。與肝纖維化密切相關(guān)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路為MAPK通路、 PPARγ-NFκB信號(hào)通路、TGF-β通路、Wnt信號(hào)通路。差異蛋

10、白中主要的生物學(xué)過程為代謝，其中氨基酸合成和代謝，糖代謝，脂肪酸合成和代謝為主要的過程。
　　結(jié)論：1、利用計(jì)算機(jī)文本挖掘技術(shù)提取砷致病機(jī)制研究中的現(xiàn)狀、熱點(diǎn)和主題，從全局的角度上進(jìn)行分析和把控，為進(jìn)一步的研究提供文獻(xiàn)理論基礎(chǔ)。2、砷暴露與肝纖維化發(fā)生相關(guān)，提示砷暴露可能是肝病高發(fā)的一個(gè)危險(xiǎn)因素。3、差異蛋白中Hic-5蛋白、谷胱甘肽合成酶、原肌球蛋白與肝纖維化發(fā)生關(guān)系密切，MAPK通路、 PPARγ-NFκB信號(hào)通路、TGF-β