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文檔簡介
1、S-腺苷蛋氨酸(SAM)是一種在生物中廣泛存在并具有重要生理功能的小分子物質。臨床上將SAM用于關節(jié)炎、肝病、抑郁癥等疾病的治療,效果顯著。目前SAM主要通過微生物發(fā)酵制備,但存在產(chǎn)量低,前體L-蛋氨酸和ATP供應不足等問題。
研究者試圖通過代謝工程改造以提高菌株生產(chǎn)SAM的能力,然而SAM在微生物中的代謝途徑冗長復雜,而且不是終端代謝產(chǎn)物,僅針對主代謝途徑中涉及到的基因進行分子操作,并不能大幅度提高SAM產(chǎn)量。作為胞內重要微
2、環(huán)境的輔因子ATP/ADP、NADH/NAD+、NADPH/NADP+參與了細胞內大量的反應過程,將物質代謝途徑聯(lián)成復雜的網(wǎng)絡體系,最終導致物質代謝流的分配受到輔因子形式和濃度的牽制。因此,通過輔因子工程手段調控胞內代謝物的合成具有極大的潛力。
本論文以解析輔因子對于SAM合成的調控機理為目的,通過代謝工程策略改造大腸桿菌(Escherichia coli)和釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)胞內輔因
3、子形式和濃度,綜合運用熒光定量PCR和LC/MS/MS方法分析并總結輔因子對于產(chǎn)物合成的生理機制以及能量代謝和其他物質代謝的規(guī)律,為高產(chǎn)SAM的菌株的代謝工程改造提供理論基礎。主要研究工作如下:
1.建立基于合成的sRNA技術用于E.coli體系胞內輔因子調控的系統(tǒng),通過干擾基因轉錄水平調控胞內輔因子水平。構建靶向紅色熒光蛋白的sRNA結合流式細胞儀和熒光定量PCR,證實了該策略可有效調控胞內基因轉錄表達,弱化效率可達85%。
4、應用該策略調控副產(chǎn)物競爭消耗ATP和NADPH的代謝途徑相關基因,構建了相應的合成sRNA: anti-proB,anti-glnA,anti-argB,anti-aroE,anti-argC,anti-proA,anti-ilvC和anti-proC。通過熒光定量PCR結果表明目標基因的轉錄水平都有不同程度的降低。與對照菌相比,帶有合成sRNA的重組菌胞內ATP水平和NADPH水平均有所提高,胞內SAM產(chǎn)量提高約1倍。
2.
5、在E.coli中通過分別引入NADH激酶(pos5p)以及轉氫酶(PntAB)和NAD激酶(YfjB)聯(lián)用構建兩種NADPH再生系統(tǒng)。分析NADPH濃度、NADPH/NADP+比率變化對于胞內物質代謝的擾動及產(chǎn)物SAM合成的關系,發(fā)現(xiàn)通過NADPH再生系統(tǒng)提高NADPH水平及NADPH/NADP+比率可以有效地促進胞內SAM的合成。其中基于NADH激酶再生系統(tǒng)使得胞內SAM產(chǎn)量提高13倍,產(chǎn)量達5.30mg/L。
3.由于S.
6、cerevisiae中的NADPH在線粒體和細胞質中的代謝相對獨立,因此在E.coli的研究基礎上,以S.cerevisiae BY4741單倍體模式菌株為研究對象,研究了不同亞細胞結構內NADPH對于產(chǎn)物合成的影響。通過激光共聚焦顯微鏡證實了成功在S.cerevisiae線粒體中表達了NADH激酶(pos5編碼),在細胞質中表達了不帶信號肽的NADH激酶(pos5△17編碼)。實驗發(fā)現(xiàn)細胞質中NADPH再生的菌株NBYSM-1合成SA
7、M的能力以及NADH/NAD+比率、ATP水平均要明顯高于線粒體中NADPH再生的菌株NBYSM-2,NADPH/NADP+比率低于NBYSM-2。說明NADPH對于菌株合成SAM產(chǎn)量有促進作用,ATP對SAM的合成影響更為重要。
4.以S.cerevisiae為研究宿主,在過表達sam2的基礎上,構建了多種不同形式的ATP調控系統(tǒng),pRS425-PHXT7-noxE-THXT7,pRS425-PHXT7-vhb-THXT7,
8、pRS425-PHXT7-ptxD-THXT7和pRS425-PHXT7-fdh1-THXT7。結果表明S-腺苷蛋氨酸合成酶活性對于SAM的合成影響極為重要,過表達sam2的菌株胞內SAM產(chǎn)量提高一倍。vhb和ptxD對于胞內SAM的合成有較為顯著的促進作用,其中菌株ABYSM-2發(fā)酵28 h胞內SAM濃度最高,與對照相比提高67%,可達54.92 mg/L。借助液質結合代謝組分析,發(fā)現(xiàn)重組菌株和對照菌株的代謝物差異較大,其中氨基酸途徑
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