人類細胞周期及凋亡網(wǎng)絡(luò)的模型建立與模擬分析研究.pdf

1、系統(tǒng)生物學的發(fā)展使得生物建模和計算機模擬成為生物過程模擬中越來越重要的手段，可以有力地支持生物學家及其他研究人員在醫(yī)學和制藥等領(lǐng)域的研究。將生物實驗的機理抽象轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的數(shù)學模型，是目前系統(tǒng)生物學與生物信息學的主要任務(wù)之一。另一方面，將這些數(shù)學模型在軟件平臺上可視化的表達與實現(xiàn)，已經(jīng)成為了模擬生物網(wǎng)絡(luò)強有力的輔助手段，可以進行生物實驗中不便于展開的操作。
　　細胞周期的生物機理已經(jīng)展開了大量的研究，但是直到最近仍然有新的實驗結(jié)論出

2、現(xiàn)。一些非編碼的miRNA已經(jīng)被確認能夠參與細胞網(wǎng)絡(luò)中的調(diào)控，例如細胞周期網(wǎng)絡(luò)。
　　本文整合最新發(fā)現(xiàn)的生物實驗結(jié)論，將這些結(jié)論結(jié)合到已有的細胞周期模型中，定性的將miRNA對靶mRNA的調(diào)控也加入其中。更進一步的設(shè)計出定性合理的可伸縮時鐘模型，可以更好的模擬該網(wǎng)絡(luò)。然后將整合好的模型通過 CellMatlab軟件平臺模擬實現(xiàn)，驗證了該模型。并且通過一系列的模擬實驗預測了在同時受到 miRNA抑制的前提下，miRNA的靶mRNA具

3、有正協(xié)同作用；miRNA與細胞周期網(wǎng)絡(luò)的系統(tǒng)一樣，具有飽和性。
　　細胞凋亡網(wǎng)絡(luò)的機理仍在廣泛的研究中，其中p53居于其上游的核心位置。更是有研究表明，該網(wǎng)絡(luò)與細胞周期網(wǎng)絡(luò)存在著緊密聯(lián)系。二者的相互作用在醫(yī)療領(lǐng)域研究對癌癥的治療具有重要意義。本文主要考察細胞凋亡網(wǎng)絡(luò)重要轉(zhuǎn)錄因子p53與周期網(wǎng)絡(luò)重要轉(zhuǎn)錄因子E2F的關(guān)系，逐步抽象建立了關(guān)于二者的負反饋環(huán)模型。在此模型基礎(chǔ)上，通過穩(wěn)態(tài)分析，推導并討論了p53抑制 E2F通路對細胞狀態(tài)的