豪豬狀魚鱗病一家系外顯子組測序分析.pdf

1、[目的]
　　 1.描述一個豪豬狀魚鱗病家系的臨床特點、組織病理。
　　 2.檢測該家系潛在致病基因情況。
　　 [方法]
　　 收集1個豪豬狀魚鱗病家系的臨床資料，取先證者皮損進行組織病理檢查。收集該家系1例患者和其父母外周血，提取基因組DNA，利用Agilent SureSelect外顯子捕獲技術(shù)結(jié)合新一代高通量測序平臺Illumina Hiseq2000、生物信息學(xué)分析技術(shù)以及Sanger法排除假陽

2、性結(jié)果等步驟，初步篩出候選基因。
　　 [結(jié)果]
　　 該家系三代共6人，其中1人發(fā)病。15歲男性患者出現(xiàn)全身性角化丘疹、斑塊14年。體檢發(fā)現(xiàn)全身彌漫性角化丘疹、斑塊，以雙膝關(guān)節(jié)、雙脛前為甚。雙手指甲出現(xiàn)裂隙及甲縱嵴、褐色變，增厚，脆性增加。皮損組織病理檢查顯示顯著的角化過度，局部角化不全，棘層中上部散在角化不良細胞，真皮淺層血管周圍中等密度淋巴細胞為主炎細胞浸潤。
　　 通過外顯子測序我們得到每個樣本大約3-3

3、.3 Gb的數(shù)據(jù)。過濾掉不在外顯子區(qū)域的單核苷酸變異體(SNV)，落在外顯子區(qū)域的3個標本中檢測到單核苷酸變異體的數(shù)目分別為18529個（患者），18137個（父親）和17821個（母親），過濾掉公共數(shù)據(jù)庫(dbSNP123和1000 Genome Project)的常見變異;過濾掉同義突變、實驗的正常對照突變;利用軟件SIFT預(yù)測突變對蛋白功能的影響進一步篩選，整合患者及其父母三者非共有的非同義突變共篩選出49個候選基因。