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文檔簡介
1、目的:檢測人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達譜,建立miRNA 參與調(diào)控胚胎著床的生物信息網(wǎng)絡(luò)。
方法:雙通道微陣列技術(shù)檢測人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達譜,應(yīng)用MMIA在線服務(wù)器進行靶mRNA基因預(yù)測,用Cytoscape 軟件構(gòu)建由miRNAs和mRNAs組成的生物信息網(wǎng)絡(luò),通過MAS在線服務(wù)器對生物信息網(wǎng)絡(luò)中差異表達mRNAs基因進行功能分類,預(yù)測miRNA 參與調(diào)控胚胎著床的關(guān)鍵分子通路。
結(jié)
2、果:
1.著床窗口期有72個miRNAs 差異表達,其中50個顯著上調(diào),22個顯著下調(diào)(fold change=2,q value<0.01);
2.除去23 種miRNAs 未能預(yù)測到靶基因外,余下49 種miRNAs 預(yù)測到6106 種擁有唯一官方基因符號的靶mRNAs基因。對于每個差異表達的miRNA 來說,預(yù)測mRNAs 靶基因的數(shù)量存在較大差異;
3.篩選出著床窗口期差異表達的miRN
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