MCP-1基因多態(tài)性與海原回族結(jié)核病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、目的：結(jié)核病的發(fā)生與發(fā)展是結(jié)核分枝桿菌與宿主之間相互作用的結(jié)果，宿主免疫遺傳因素在結(jié)核病發(fā)生發(fā)展過程中起著非常重要的作用。本研究選擇結(jié)核病主要候選基因單核細胞趨化蛋白-1(MCP-1)基因的2個SNPs rs1024611(G/A)和rs1024610(A/T),探討它們在海原人群結(jié)核病發(fā)生中的作用，并構(gòu)建單倍體型，研究其在海原回族人群中與結(jié)核病的易感性是否有關(guān)聯(lián)。
　　 方法：采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例-對照研究設(shè)計,選擇海原地區(qū)

2、141例臨床確診的肺結(jié)核病患者,平均年齡為(34.95±18.78)歲,另選擇與其年齡、性別相匹配的152例健康人群作為對照,平均年齡為(32.52±15.68)歲。應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)法檢測rs1024611(G/A)、rs1024610(A/T)多態(tài)性位點的基因型，用軟件SPSS 11.5計算基因型頻率、等位基因頻率并進行卡方檢驗，用軟件SHEsis進行2個SNP位點的連鎖不平衡檢驗，并構(gòu)建

3、單倍體型。
　　 結(jié)果：(1)對病例和對照人群中的2個基因多態(tài)性位點的基因頻率進行檢驗，均符合Hardy-Weinberg平衡定律，表明各基因型頻率在海原人群中已達遺傳平衡，所選樣本具有群體代表性。(2)rs1024611(G/A)的GG、GA和AA基因型在病例組中的分布頻率分別為34.8％、53.9％和11.3％，在對照組中的分布頻率分別為26.3％、50.7％和23％。以rs1024611AA基因型為參照組，GA基因型、GG

4、基因型在病例組中的分布頻率均顯著高于對照組，(P值分別為0.006和0.001；OR值分別為2.468和3.500)，G和A等位基因在病例組中的分布頻率分別為61.7％和38.3％，在對照組中的分布頻率分別為48.4％和51.6％，卡方檢驗后，兩組差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001，OR=1.721)。(3)rs1024610(A/T)的AA和AT基因型在病例組中的分布頻率分別為77.3％和22.7％，在對照組中的分布頻率分別為86.2％

5、和13.8％。尚未發(fā)現(xiàn)TT基因型，這與Hapmap計劃公布的TT基因型在亞洲人群中極為罕見是一致的。以rs1024610AA基因型為參照組，rs1024610AT基因型在病例組與對照組中的分布有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.034；OR=1.906)。A和T等位基因在病例組中的分布頻率分別為88.7％和11.3％，在對照組中的分布頻率分別為93.1％和6.9％，卡方檢驗后，兩組差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.045，OR=1.786)。(4)rs102

6、4611(G/A)和rs1024610(A/T)處于非連鎖不平衡關(guān)系(D’=0.327，r2=0.013)。(5)使用軟件SHEsis構(gòu)建rs1024611(G/A)和rs1024610(A/T)的單倍型，共有4種單倍型。其中AA*單倍型在病例組和對照組中的頻率分別為34.2％和46.1％，AT*單倍型在病例組和對照組中的頻率分別為41％和55％，GA*單倍型在病例組和對照組中的頻率分別為54.5％和47％，GT*單倍型在病例組和對照組

7、中的頻率分別為7.2％和1.4％；以AA*單倍型為參照組，進行卡方檢驗后，GA*型在病例組與對照組中的分布有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.01，OR=1.571)，GT*型在病例組與對照組中的分布有顯著性差異(P=0.000，OR=7.292)。
　　 結(jié)論：(1)SNP rs1024611(G/A)多態(tài)性與寧夏海原回族結(jié)核病的發(fā)病有一定的關(guān)聯(lián)性,其GG、GA基因型可能是海原回族人群對結(jié)核病的易感因素。(2)SNP rs1024610(A