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文檔簡介
1、目的:本研究利用全基因組DNA甲基化測序技術(shù),探討DNA甲基化修飾改變與童年創(chuàng)傷和抑郁癥之間的關(guān)系,初步了解DNA甲基化在童年創(chuàng)傷和抑郁癥機制中的作用。
方法:本研究分為伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組共四組,每組各3例。分別抽提各樣本外周血組織中的基因組DNA,并采用MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation sequ
2、encing)測序技術(shù)進行DNA甲基化測序。
結(jié)果:通過運用MeDIP-seq測序技術(shù),本階段獲得測序深度足夠和高分辨率的外周血全基因組DNA甲基化譜。本次測序結(jié)果的整體原始數(shù)據(jù)高達60Gb,組間比較、GO(gene ontology)功能分析和Pathway分析后整體數(shù)據(jù)約80Gb。根據(jù)分析伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組與伴童年創(chuàng)傷健康成人組相比呈低甲基化改變的基因有11,623個,呈高甲基化改變的基因有12,772個。伴童年創(chuàng)傷抑
3、郁癥患者組與不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組相比呈低甲基化改變的基因有12,838個,呈高甲基化改變的基因有12,709個。伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組相比呈低甲基化改變的基因有12,228個,呈高甲基化改變的基因有12,664個。不伴童年創(chuàng)傷抑郁患者組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組相比呈低甲基化改變的基因有12,039個,呈高甲基化改變的基因有13,661個。GO分析顯示甲基化異常改變明顯的基因類型包括:生物進程的(biologic
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