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文檔簡介
1、第一部分、髓樣分化因子88(Myd88)與腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子6(TRAF6)外顯子編碼區(qū)突變位點篩選
背景:類風濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis RA)是以慢性對稱性多關(guān)節(jié)損害為主要表現(xiàn)的一種全身性自身免疫性疾病,病因與發(fā)病機制目前尚未闡明。隨著免疫遺傳學的發(fā)展,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),固有免疫在RA發(fā)病和病情進展中具有重要作用,TOLL樣受體(Toll-like receptor TLR)信號傳導通路是介
2、導固有免疫的經(jīng)典通路,近年來TLR信號傳導通路與自身免疫性疾病的研究成為熱點。TLR信號傳導通路包括髓樣分化因子88(myeloid differentiation factor88 MyD88)依賴性途徑和MyD88非依賴性途徑。MyD88依賴途徑是大部分TLR信號傳導通路共用途徑,MyD88、TRAF6(tumor necrosis factor receptor2 associated factors,TRAF6)是該通路中重要的
3、接頭蛋白。對RA患者MyD88、TRAF6基因突變位點篩選可能從遺傳學角度了解固有免疫在RA發(fā)病機制中的作用。
目的:對RA患者MyD88、TRAF6外顯子編碼區(qū)區(qū)域基因測序,試圖發(fā)現(xiàn)RA患者該區(qū)域的突變位點,以便進一步探索Toll樣受體信號傳導通路中MyD88、TRAF6基因多態(tài)性與RA的關(guān)聯(lián)。
方法:
1.選取30例RA患者全血標本,提取DNA。
2.應用聚合酶鏈反應(PCR)擴增DNA片段,
4、并鑒定、純化其產(chǎn)物。
3.利用測序儀分別對MyD88、TRAF6基因外顯子5個編碼區(qū)進行測序,試圖發(fā)現(xiàn)新的突變位點。
結(jié)果:30例RA患者DNA標本MyD88、TRAF6基因外顯子5個編碼區(qū)基因序列與基因庫已知序列完全一致。
結(jié)論:未發(fā)現(xiàn)RA患者MyD88、TRAF6基因外顯子編碼區(qū)新的突變位點。
第二部分、類風濕關(guān)節(jié)炎與Toll樣受體信號傳導通路中MyD88基因多態(tài)性關(guān)聯(lián)的研究
背景:
5、研究顯示天然免疫在RA發(fā)病和病情進展中起重要作用,而Toll-like receptors(TLRs)與RA病情進展的關(guān)系成為近年來研究熱點。MyD88是TLR家族成員信號通路必要的轉(zhuǎn)接分子,介導上游信號向下游傳導,參與TNF-α、IL-1、IL-6等炎性因子激活,因此,了解MyD88及其下游炎性因子的基因多態(tài)性與RA的相關(guān)性,有助于明確RA的病因與發(fā)病機制。
方法:
1.選取162例RA患者和188例正常對照的全血
6、標本,搜集RA患者RF-IgA、RF-IgG、RF-IgM、CCP、RA33、GPI抗體數(shù)據(jù)。
2.提取DNA,對SNP位點rs7744基因分型。
3.統(tǒng)計學分析病例組與對照組之間的基因型頻率、等位基因頻率。
4.統(tǒng)計學分析RA患者基因型頻率、等位基因頻率與各臨床表型之間的關(guān)系。
結(jié)果:
1.MyD88位點rs7744病例組與對照組的三種基因型頻率AA、AG、GG無統(tǒng)計學差異(P>0.0
7、5),A/G等位基因頻率差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
2.GPI陽性的RA患者AG基因型比例高于GPI陰性RA患者,其比例分別為57.7%、35.3%(P<0.05)。
結(jié)論:
1.RA患者rs7744的基因型頻率、等位基因型頻率無性別差異。
2(。)rs7744的基因型頻率、等位基因型頻率在RF-IgA、RF-IgG、RF-IgM、CCP、RA33呈陽性的RA患者與陰性患者間均無統(tǒng)計學差異
8、。
3.GPI陽性的RA患者出現(xiàn)AG雜合基因型的比例較高,提示rs7744位點雜合基因型AG可能與RA抗體GPI關(guān)聯(lián)。
第三部分、類風濕關(guān)節(jié)炎與Toll樣受體信號傳導通路中TRAF6基因多態(tài)性關(guān)聯(lián)的研究
背景:類風濕關(guān)節(jié)炎是一種多因子病,遺傳因素與環(huán)境因素在這一過程中發(fā)揮著重要作用,Toll樣受體(TLR)/IL-1R信號傳導途徑的活化與類風濕性關(guān)節(jié)炎的發(fā)生與發(fā)展明顯相關(guān)。在此信號傳導通路中,TRAF6的激
9、活可以促進炎性因子的表達,從而導致類風濕關(guān)節(jié)炎病情的不斷惡化進展,本實驗通過探討TRAF6基因突變與RA的關(guān)聯(lián),試圖進一步明確兩者之間的相關(guān)性。
方法:
1.選取162例RA患者和188例正常對照的全血標本,搜集RA患者RF IgA、RF-IgG、RF-IgM、CCP、RA33、GPI抗體數(shù)據(jù)。
2.提取DNA,對SNP位點rs030445基因分型。
3.統(tǒng)計學分析病例組與對照組之間的基因型頻率、
10、等位基因頻率。
4.統(tǒng)計學分析RA患者基因型頻率、等位基因頻率與各臨床表型之間的關(guān)系。
結(jié)果:
1.TRAF6 SNP位點rs5030445病例組與對照組的三種基因型頻率AA、AG、GG無統(tǒng)計學差異(P>0.05),A/G等位基因頻率差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
2.RA的7個臨床表型中,性別、RF-IgG、RF-IgM、CCP、RA33、GPI與rs5030445基因型頻率、等位基因型頻率
11、均為無統(tǒng)計學差異。RF-IgA陽性RA患者A等位基因頻率明顯高于RF-IgA陰性RA患者,比例分別為14.6%、6.8%(P<0.05)。
結(jié)論:TRAF6rs5030445位點攜帶A等位基因的患者出現(xiàn)RF-IgA陽性的幾率可能較高,A等位基因可能為RA的易感基因。
第四部分、類風濕關(guān)節(jié)炎與白介素家族(IL-1RAP、IL-6、IL-6R)基因多態(tài)性關(guān)聯(lián)的研究
背景:類風濕關(guān)節(jié)炎是遺傳因素和環(huán)境因素共同作用
12、的結(jié)果,易感基因與RA的關(guān)系密不可分。IL-1在類風濕關(guān)節(jié)炎發(fā)病的過程中不僅參與血管翳與滑膜炎癥的形成,而且對骨與軟骨的破壞起重要作用。IL-6是一種前炎癥因子,能夠誘導IFN-γ和腫瘤壞死因子α及各種趨化因子的表達,與RA的發(fā)病關(guān)系密切。通過研究IL-1RAP、IL-6、IL-6R基因多態(tài)性與類風濕關(guān)節(jié)炎的關(guān)聯(lián),從遺傳學角度進一步探討IL-1RAP、IL-6、IL-6R在RA發(fā)病機制中的作用。
方法:
1.選取16
13、2例RA患者和188例正常對照的全血標本。
2.提取DNA,對IL-1RAP、IL-6、IL-6R SNP位點rs766442(IL-1RAP)、rs6946864(IL-6)、rs11265618(IL-6R)、rs4845626(IL-6R)基因分型。
3.統(tǒng)計學分析病例組與對照組之間的基因型頻率、等位基因頻率。
4.統(tǒng)計學分析RA患者基因型頻率、等位基因頻率與各臨床表型之間的關(guān)系。
結(jié)果:<
14、br> 1.RA組IL-1RAPrs766442基因型頻率、等位基因頻率與正常對照組之間差異均具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。RF-1gG陽性的RA患者TT基因型比例(84.8%)高于RF-IgG陰性的RA患者(70.3%),差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
2.RA組IL-6 SNP位點rs6946864基因型頻率、等位基因頻率與正常對照組之間無統(tǒng)計學差異。
3.RA組IL-6R的SNP位點rs4845626
15、基因型頻率、等位基因頻率與正常對照組之間無統(tǒng)計學差異。IL-6R的SNP位點rs11265618基因型頻率與正常對照組之間無統(tǒng)計學差異。RA組C/T等位基因頻率0.928/0.108,正常對照組等位基因頻率0.941/0.059,兩組問差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
結(jié)論:
1.IL-1RAPrs766442的TT基因型可能與RA關(guān)聯(lián),攜帶T等位基因的RA患者RF-IgG陽性的幾率可能較高。
2.IL
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