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文檔簡介
1、目的: 建立套式逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Nested RT-PCR)檢測臨床樣本副流感3型病毒(HPIV3)基因的方法,并進一步對擴增產(chǎn)物進行序列分析,結(jié)合臨床資料,分析蘭州地區(qū)HPIV3的感染現(xiàn)狀及特征。 方法: 1.收集2005年7月~12月,2006年10月~2007年3月蘭州地區(qū)的呼吸道感染患兒的300份鼻咽部分泌物(NPS)標本。其中男性162例,女性138例。年齡4天~14歲。 2.根據(jù)HPIV3
2、血凝素蛋白(HN)的基因保守區(qū)設(shè)計引物,用套式RT-MR檢測NPS里的HPIV3基因。 3.對HPIV3在小兒ARI(acute respiratory tract infection)中所占的比例、性別、年齡、季節(jié)分布及臨床特點進行分析。 4.隨機選取11份HPIV3陽性序列,與Genebank上的已知序列進行比對,繪制遺傳進化樹,從基因進化角度對蘭州地區(qū)HPIV3的進化特征進行初步探討。 結(jié)果: 1.
3、300例標本用套式RT-PCR檢測出HPIV3陽性46例,占總檢測標本的15.33%(46/300)。 2.在HPIV3陽性46例中,男性26例,感染率為16.04%(26/162),女性20例,,感染率為14.49%(20/138),男性比女性略高。年齡小于3歲的有42例,占總檢出率的91.30%(42/46),其中1歲以下的有17例,占總檢出率的36.96%(17/46)。急性上呼吸道感染(URI)患兒標本192例,其中HP
4、IV3檢測陽性標本32例,(陽性率為16.67%),急性下呼吸道標本108例,其中HPIV3陽性14例(陽性率為12.96%)。 3.在所收集標本月份中,每個月份均有HPIV3的檢出,其中2005年11月,2007年1月,2月為高峰期。 4.隨機選取11份陽性標本送檢測序,測得的核苷酸序列經(jīng)過blast軟件比較,與GeneBlank中的已知的HPIV3序列同源性在91.0%~99.6%之間。序列結(jié)果分析提示,隨機選取的R
5、T-PCR陽性的11例標本是HPIV3陽性。 5.基因進化樹分析顯示,11份陽性樣本序列屬同一進化枝,6份2006年,10月~2007年,3月的樣本序列除145SEQ外屬同一進化分枝。而5份2005年的樣本序列除1630SEQ外,與日本分離株同屬同一進化分枝。 結(jié)論: 1.HPIV3在蘭州地區(qū)呼吸道感染患兒中占較高的比例,是引起小兒呼吸道感染的重要呼吸道病原之一,其所致呼吸道感染以3歲以下嬰幼兒多見,尤以1歲以下為多,但
6、男女感染比例無顯著性差異(X<'2>=0.3956 P>0.05),上下呼吸道感染率無顯著差異(X<'2>=0.7303P>0.05)。 2.HPIV3在蘭州地區(qū)2005年,7月~12月,2006年,10月~2007年,3月中每個月均有散發(fā),但在冬春季形成流行高峰。 3.套式RT-PCR檢測方法用于HPIV3的基因診斷具有特異性強,檢出率高的優(yōu)點。 4.通過基因進化樹的分析顯示,2005年樣本序列與2006年樣本
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