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文檔簡介
1、第一部分無腦畸形胎兒腦組織microRNAs的差異表達
背景:神經(jīng)管畸形(neural tube defects,NTDs)是人類最常見的一種出生缺陷,其中無腦畸形是最常見的類型之一。NTDs的病因非常復雜,目前認為主要是遺傳和環(huán)境的相互作用造成。microRNAs是一種參與基因轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控的非編碼RNAs,在多種生命活動如胚胎神經(jīng)發(fā)育中均可發(fā)揮重要作用,隨著人們對microRNAs的逐漸認識,推測其和相應(yīng)的靶基因有可能在N
2、TDs的發(fā)生中起作用。
目的:探討無腦畸形胎兒殘存腦組織和正常引產(chǎn)胎兒腦組織中microRNAs的差異表達譜,并運用生物信息學手段預(yù)測這些miRNAs的靶基因。
方法:利用Affymetrix公司推出的GeneChip? miRNA表達譜芯片分析無腦畸形胎兒殘存腦組織和正常引產(chǎn)胎兒腦組織中miRNAs的差異表達。采用實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(Real-time RT-PCR)對差異表達顯著的10個miRNAs進行進一
3、步驗證。運用數(shù)據(jù)庫預(yù)測上述經(jīng)過驗證的miRNAs的靶基因。
結(jié)果:1. miRNA芯片初篩結(jié)果:與正常對照組相比,無腦兒組有87個miRNAs表達差異顯著(兩組差異>2倍)。其中表達上調(diào)的miRNAs有73個,表達下調(diào)的有14個。
2.根據(jù)表達差異顯著性程度和在腦組織中表達的特異性,選取上述有顯著表達差異的miRNAs中的10個miRNAs行real-time PCR進行驗證。發(fā)現(xiàn)mir-103、mir-132、mi
4、r-138、mir-185、mir-23a、mir-134、mir-22、mir-34a和mir-149的檢測結(jié)果與miRNA芯片初篩結(jié)果一致,其中表達上調(diào)的有mir-103、mir-132、mir-138、mir-185、mir-23a、mir-134、mir-22和mir-34a;表達下調(diào)的為mir-149。mir-125a的結(jié)果與芯片結(jié)果相反。
結(jié)論:經(jīng)過miRNA芯片初篩和進一步的real-time PCR驗證,一定數(shù)
5、目的miRNAs可能通過調(diào)控多個途徑中的靶基因從而參與無腦畸形的發(fā)生。
第二部分miR-34a對人腦膠質(zhì)母細胞瘤中Notch信號通路的影響
背景:既往研究發(fā)現(xiàn)一些miRNAs對葉酸代謝和NTDs的發(fā)生可能有一定的影響,尤其是miR-34a。根據(jù)前期數(shù)據(jù)庫預(yù)測Notch1和Dll1基因可能是受miR-34a調(diào)控的靶基因。同時有研究結(jié)果顯示Notch信號通路在胚胎神經(jīng)形成過程中可能起著重要的調(diào)節(jié)作用,故推測miRNA可能
6、通過調(diào)控如Notch等重要的信號通路影響神經(jīng)形成過程。
目的:根據(jù)前期芯片的篩選結(jié)果,探討miR-34a對人腦膠質(zhì)母細胞瘤Notch信號通路的影響。
方法:利用miR-34a mimics脂質(zhì)體瞬時轉(zhuǎn)染人腦膠質(zhì)母細胞瘤細胞株U87,轉(zhuǎn)染24h后用real-time RT-PCR和Western blot技術(shù)檢測Notch信號途徑中Notch1和Dll1基因mRNA和蛋白表達水平,同時檢測轉(zhuǎn)染后胞內(nèi)miR-34a的mR
7、NA水平。
結(jié)果:經(jīng)轉(zhuǎn)染miR-34a mimics的U87細胞內(nèi)has-miR-34a表達明顯升高,而Notch1和Dll1基因的mRNA水平?jīng)]有明顯變化,蛋白表達水平則有明顯降低。
結(jié)論:miR-34a mimics可通過上調(diào)胞內(nèi)miR-34a的水平,從而抑制其預(yù)測靶基因Notch1和Dll1的蛋白而非mRNA的表達,提示它是在轉(zhuǎn)錄后的翻譯水平發(fā)揮對靶基因的調(diào)控作用。miR-34a可能通過下調(diào)Notch信號途徑而
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