MTHFR、TS、RFCI和ATIC基因多態(tài)性在人群中的分布及其與MTX治療反應(yīng)的相關(guān)性研究.pdf

1、目的：
　　了解亞甲基四氫葉酸還原酶（MTHFR）677C>T和1298A>C、胸甘酸合成酶（TS）5’-UTR28bp重復(fù)序列3R/2R和3’-UTR6bp缺失或插入（6bp-/6bp+）、還原性葉酸載體RFC180G>A、氨基咪唑胺甲酰轉(zhuǎn)移酶（ATIC）347C>G單核苷酸多態(tài)性（SNP）在潮汕正常人群和強(qiáng)直性脊柱炎（AnkylosingSpondylitis，AS）、類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎（RheumatoidArthritis，RA

2、）、系統(tǒng)性紅斑狼瘡（SystemicLupusErythematosus，SLE）患者的分布，及其與MTX治療反應(yīng)的關(guān)系。
　　對(duì)象和方法：
　　268名潮汕健康人、160例AS、167例RA和48例SLE連續(xù)病例納入研究。用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）檢測(cè)TS5'-UTR3R/2R多態(tài)性、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性（PCR-RFLP）方法檢測(cè)MTHFR677C>T、1298A>C、TS3'-UTR6bp-/6bp+、

3、RFC180G>A的多態(tài)性。采用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序的方法檢測(cè)ATIC347C>G多態(tài)性。對(duì)接受MTX治療半年以上的96例RA、78例AS患者進(jìn)行療效分析。接受MTX治療的160例AS、167例RA和48例SLE進(jìn)行MTX不良反應(yīng)分析。
　　結(jié)果：
　　MTHFR677T、1298C，TS5’-UTR2R、3’-UTR6bp+，RFC180A和ATIC347G等位基因突變頻率在潮汕正常漢族人群分別為23.3％、27.4%，18

4、.8%、27.6%，50.9%和32.8%；強(qiáng)直性脊柱炎分別為25.0%、23.4%，20.0%、30.3%，49.7%和30.6%；類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎分別為25.7%、24.3%，17.1%、26.3%，54.2%和31.7%；系統(tǒng)性紅斑狼瘡分別為27.1%、27.1%，19.8%、27.1%，50.0%和17.7%。各基因型分布均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡。兩性間SNP分布無(wú)顯著差異。
　　潮汕正常人677T等位基因突

5、變頻率和國(guó)內(nèi)大部分南方漢族和少數(shù)民族接近，但低于北方漢族和少數(shù)民族；1298C等位基因突變頻率高于北方漢族人群，低于南方少數(shù)民族人群；其余四個(gè)位點(diǎn)突變頻率和國(guó)內(nèi)漢族和少數(shù)民族接近。
　　強(qiáng)直性脊柱炎六個(gè)位點(diǎn)基因型、等位基因、單倍體頻率與正常人群無(wú)顯著差異。性別分層發(fā)現(xiàn)，女性攜帶1298AC基因型者發(fā)生AS的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶1298AA者的0.298倍（95%CI0.092-0.967）。基因型組合分析顯示，攜帶677CC-1298AC、

6、677CC-1298CC、677CT-1298AA型者發(fā)生AS的風(fēng)險(xiǎn)分別是攜帶677CC-1298AA型者的0.46、0.31和0.48倍。性別分層結(jié)果，男性攜帶這4種基因型組合者發(fā)生AS的風(fēng)險(xiǎn)是野生型組合者的0.50、0.19和0.49倍。其余位點(diǎn)基因型組合在AS和對(duì)照組間無(wú)顯著差異。
　　類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎六個(gè)位點(diǎn)基因型、等位基因、單倍體頻率與正常人群也無(wú)顯著差異?；蛐徒M合分析顯示，攜帶677CC-1298AC、677CT-129

7、8AA基因型組合者發(fā)生RA的風(fēng)險(xiǎn)分別是677CC-1298AA者的0.55倍和0.52倍。性別分層結(jié)果，男性攜帶677CT-1298AA者發(fā)生RA的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶677CC-1298AA者的0.17倍；攜帶RFC180GA-ATIC347CC、RFC180GA-ATIC347GC、RFC180AA-ATIC347CC和RFC180AA-ATIC347GC基因型組合者發(fā)生RA的風(fēng)險(xiǎn)分別是RFC180GG-ATIC347CC者的0.12倍、0.

8、25倍、0.21倍和0.20倍。
　　系統(tǒng)性紅斑狼瘡病人中，攜帶ATIC347GC基因型者發(fā)生SLE的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶CC型者的0.52倍（95%CI0.27-0.99），性別分層結(jié)果，女性攜帶ATIC347GC基因型者發(fā)生SLE的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶CC型者的0.40倍（95%CI0.19-0.85）。其余位點(diǎn)突變基因頻率、基因型、單倍體以及基因型組合均和正常人群無(wú)顯著差異。
　　類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎單用MTX“治療反應(yīng)好組”攜帶MTHFR129

9、8C突變基因頻率顯著高于“治療反應(yīng)中組”和“無(wú)治療反應(yīng)組”（39.3%vs.16.7%和17.9%）。攜帶MTHFR1298C突變基因者發(fā)生治療反應(yīng)好的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶1298A者的3.235倍（95%CI1.065-9.824）；發(fā)生肝損害的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶1298A者的2.511倍（95%CI1.226-5.142）。
　　強(qiáng)直性脊柱炎病人單用MTX“治療無(wú)反應(yīng)組”攜帶MTHFR677CT基因型頻率顯著高于“治療反應(yīng)中組”（71.4%vs

10、.18.8%，p=0.007）。攜帶MTHFR677CT基因型者發(fā)生治療無(wú)反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶677CC基因型者的13.333倍（95%CI2.189-81.228）；攜帶677T突變基因者發(fā)生治療無(wú)反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶677C者的4.05倍（95%CI1.204-13.619）。攜帶TS6bp+/6bp+基因型者發(fā)生不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶6bp-/6bp-者的3.85倍（95%CI1.10-13.53）。
　　系統(tǒng)性紅斑狼瘡攜帶MTHFR

11、1298AA者發(fā)生副作用的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶1298AC者的12.47倍（95%CI1.44-108.28），攜帶1298A等位基因者發(fā)生副作用的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶1298C者的5.38倍（95%CI1.49-19.42），非677C-1298C單倍體攜帶者發(fā)生副作用的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶677C-1298C單倍體者的3.752倍（95%CI1.02-13.8）。攜帶TS3’-UTR6bp-/6bp-者發(fā)生副作用的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶6bp+/6bp-者的9.0倍（95%

12、CI1.03-79.03)。攜帶ATIC347GC者發(fā)生副作用風(fēng)險(xiǎn)是攜帶ATIC347CC者的4.622倍（95%CI1.198-17.834），攜帶ATIC347G等位基因者發(fā)生副作用風(fēng)險(xiǎn)是攜帶ATIC347C等位基因者的3.012倍（95%CI1.015-8.940）。
　　所有病人中攜帶MTHFR677TT基因型者發(fā)生因MTXADR停藥的風(fēng)險(xiǎn)是677CC基因型的2.57倍（95%CI1.107-5.972）。
　　結(jié)論

13、：
　　潮汕漢族正常人677T等位基因突變頻率和國(guó)內(nèi)大部分南方漢族和少數(shù)民族接近，低于北方漢族和少數(shù)民族。1298C等位基因突變頻率高于北方漢族人群，低于南方少數(shù)民族。其余四個(gè)位點(diǎn)SNP在中國(guó)人群相對(duì)穩(wěn)定。MTHFR677C>T和1298A>C、TS5’-UTR3R/2R和3’-UTR6bp-/6bp+、RFC180G>A、ATIC347C>G多態(tài)性與AS、RA、SLE發(fā)病無(wú)顯著相關(guān)。MTHFR1298C突變基因與MTX治療RA反