鴨MC1R基因的克隆測(cè)序與半番鴨羽色AFLP分子標(biāo)記.pdf

1、羽色是半番鴨重要的質(zhì)量性狀，改良羽色性狀是水禽育種學(xué)家的研究重點(diǎn)，但是改良這些性狀用常規(guī)育種方法已受到了極大的限制，應(yīng)用分子標(biāo)記輔助選擇已成為鴨育種改良的必然趨勢(shì)。在課題組白羽性狀選育的基礎(chǔ)上，從分子水平上研究探討半番鴨的羽色性狀，對(duì)進(jìn)一步提高半番鴨白羽率，快速培育出具有我國特色的大型白羽半番鴨母本品系具有重要指導(dǎo)意義。針對(duì)目前半番鴨研究現(xiàn)狀，本研究由北京鴨和半番鴨的黑素皮質(zhì)素受體1(melanocortin 1 receptor,MC

2、1R)基因克隆測(cè)序和半番鴨羽色AFLP分子標(biāo)記篩查兩部分組成，為分子標(biāo)記輔助選擇育種提供了分子遺傳基礎(chǔ)。 實(shí)驗(yàn)一，鴨MC1R基因的克隆測(cè)序：從北京鴨和半番鴨血液提取基因組DNA，根據(jù)雞、鵪鶉、雪雁、孔雀等MClR基因同源序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)引物，PCR擴(kuò)增、目的片段回收、克隆測(cè)序后進(jìn)行序列分析。結(jié)果，(1)對(duì)北京鴨和半番鴨MC1R基因進(jìn)行克隆測(cè)序，獲得了長為855bp的cDNA序列。為進(jìn)一步研究半番鴨羽色MC1R基因SNP標(biāo)記及在品

3、系選育中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)；(2)通過BLAST進(jìn)行相似性搜索，結(jié)果表明，該序列與MC1R的序列同源性最高。其中半番鴨與北京鴨的保守性最高達(dá)98.9％，兩者與雪雁也有很高的保守性，都達(dá)到97.6％，與家雞、火雞、鵪鶉、藍(lán)孔雀的同源性在91.0％～95％之間?？梢娗蓊惖腗ClR基因編碼區(qū)序列具有高度的保守性：(3)北京鴨與半番鴨核苷酸存在9個(gè)變異位點(diǎn)，其中位于229 bp(A/G)、385 bp(A/G)、634 bp(A/G)處的變異導(dǎo)致

4、了MC1R氨基酸序列分別在第77位(K/E)、129位(I/V)、212位(T/A)發(fā)生突變。 實(shí)驗(yàn)二，半番鴨羽色AFLP分子標(biāo)記的篩查：采用EeoR I/Taq I系列的64對(duì)引物重復(fù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行AFLP標(biāo)記篩查。結(jié)果，(1)白羽性狀特有的標(biāo)記初篩有10對(duì)引物含有13個(gè)特異性條帶，經(jīng)重復(fù)實(shí)驗(yàn)已獲得可靠標(biāo)記的3對(duì)引物為E-AAG/T-AAC、E-AAG/T-AGT、E-AGC/T-AAT并含有3個(gè)特異性條帶；(2)對(duì)3個(gè)白羽性狀特有