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文檔簡介
1、戊型肝炎(Hepatitis E,HE)是由戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus,HEV)引起的病毒性肝炎。HEV為無包膜、單鏈、正義 RNA病毒,其基因組全長約7.2kb,包含三個閱讀框,即 ORF1-ORF3。明確感染人的HEV可分為1-4基因型,其中3和4型既感染人也感染動物,為人畜共患性的,豬是其主要動物宿主。研究顯示,ORF3蛋白是一個多功能蛋白,參與多種機制,但 ORF3的功能至今還不明確。為了探索 HEV感染、
2、致病及不同宿主差異的機制,我們采用酵母雙雜交的方法篩選了與4型 ORF3相互作用的豬宿主蛋白,對這些蛋白的相互作用進行驗證,并采用生物信息學軟件和技術(shù)對ORF3蛋白的功能及其對宿主細胞生物過程產(chǎn)生的影響進行了分析和推測,同時也比較了人和豬宿主差異的機制。我們完成了如下工作:
1、首先對本實驗室構(gòu)建的pGBKT7-W3-ORF3誘餌質(zhì)粒進行了鑒定,然后將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化 Y2H gold酵母菌中,進行誘餌蛋白毒性、自激活檢測,并應用We
3、stern Blot檢測 ORF3蛋白在酵母菌株 Y2Hgold中的表達情況,確認 ORF3蛋白沒有毒性、沒有自激活性及在 Y2Hgold中正確表達。
2、采用大規(guī)模酵母質(zhì)粒轉(zhuǎn)化技術(shù),將豬肝 cDNA文庫質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母細胞 Y2H/pGBKT7-W3-ORF3,進行豬肝 cDNA文庫篩選,共進行了三次文庫篩選,篩選了1.09×107個cDNA文庫克隆,獲得了257個陽性克隆。
3、257個陽性克隆經(jīng)酵母質(zhì)粒提取,大腸桿
4、菌質(zhì)粒擴增,質(zhì)粒測序、自激活及與 ORF3共轉(zhuǎn)再確認,最終得到54個真陽性克隆。這54個克隆中,有50個是已知蛋白,4個是未知蛋白。
4、將篩出的54個蛋白中的51個蛋白核酸序列分別構(gòu)建至 pProlabel載體,與pAcGFP-W3-ORF3共轉(zhuǎn)293FT細胞,采用Chemiluminescent Co-IP方法對蛋白相互作用進行驗證,最終我們獲得38個相互作用蛋白。對這些蛋白進行生物信息學分析,發(fā)現(xiàn)這些蛋白分布在細胞的多個
5、部位,參與細胞代謝、細胞免疫、刺激反應、轉(zhuǎn)運等多個生物過程。推測 ORF3可能通過這些蛋白發(fā)揮多重作用。通過對蛋白功能富集聚類分析,發(fā)現(xiàn)有顯著多數(shù)量的蛋白分別參與甘氨酸絲氨酸蘇氨酸代謝、血小板激活和脫顆粒、補體和凝血級聯(lián)、不飽和脂肪的合成、血液凝固、高爾基體相關運輸?shù)纳锖铣傻壬镞^程。ORF3可能通過與目標宿主蛋白相互作用,參與這些相應的生物過程。
5、采用經(jīng)典的Co-IP方法對ORF3與 PLG、SERPINF2的相互作用
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