PLCE1基因多態(tài)性與中國(guó)中部人群食管鱗癌遺傳易感性.pdf

1、一個(gè)新的功能性單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)位點(diǎn)rs2274223，在三個(gè)基于中國(guó)人群有關(guān)食管鱗癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma，ESCC)的大規(guī)模全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)研究中均被發(fā)現(xiàn)，其位于磷脂酶Cε1(phospholipaseCepsilon1，PLCE1)基因。PLCE1基因編碼的P

2、LCE1(phospholipaseCepsilon1)蛋白是磷脂酶C(phospholipaseC，PLC)家族一個(gè)獨(dú)特的成員，其可以催化多磷酸肌醇水解，產(chǎn)生1，4，5-三磷酸(Inositol，1，4，5-triphosphate，IP3)和二酰甘油(diacylglcerol，DAG)兩種第二信使，繼而參與細(xì)胞的生長(zhǎng)和分化。因此，深入探討PLCE1基因多態(tài)性與食管鱗癌的關(guān)系尤為必要。這將為探討食管鱗癌的病因?qū)W提供科學(xué)依據(jù)，同時(shí)，這

3、將對(duì)篩選高危人群和保護(hù)易感人群有重要意義，也為采取有效的干預(yù)措施提供理論基礎(chǔ)。
　　 目的:
　　 探討PLCE1基因三個(gè)功能性位點(diǎn)的多態(tài)性與食管鱗癌的關(guān)系以及基因-基因，基因-環(huán)境的交互作用，為揭示食管癌病因?qū)W機(jī)制提供理論依據(jù)。
　　 方法:
　　 在中國(guó)中部漢族人群中，采取病例-對(duì)照研究方法，按照頻數(shù)匹配原則，選取381例醫(yī)院來(lái)源的食管鱗癌新發(fā)病例和420例健康對(duì)照，采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多

4、態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)對(duì)rs17417407位點(diǎn)和rs2274223位點(diǎn)進(jìn)行基因型檢測(cè);采用等位基因特異聚合酶鏈反應(yīng)(Allele-specificPCR，AS-PCR)技術(shù)對(duì)rs2274224位點(diǎn)進(jìn)行基因型檢測(cè)。
　　 利用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件SPSS17.0，對(duì)病例組和對(duì)照組的樣本特征進(jìn)行頻率描述，利用x2檢驗(yàn)比較食管鱗癌患者和健康對(duì)照組之間的年齡、性別、吸煙、飲酒及腫瘤家族史的差異，采用Hardy-weinberg在線(xiàn)分析軟件

5、分析Hardy-Weinberg平衡。采用非條件二分類(lèi)Logistic回歸比較各基因型在病例組和健康對(duì)照組之間分布頻率的差異。利用Haploview4.0軟件計(jì)算連鎖不平衡值(LD)值。利用SHEsis在線(xiàn)軟件進(jìn)行單體型預(yù)測(cè)、構(gòu)建及分析。利用趨勢(shì)x2檢驗(yàn)，分析突變位點(diǎn)數(shù)量與食管鱗癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的劑量反應(yīng)關(guān)系。利用多因素降維法(MDR)分析基因-環(huán)境交互作用。
　　 結(jié)果:
　　 單個(gè)SNP位點(diǎn)分析表明，rs2274223

6、位點(diǎn)突變雜合基因型AG、突變純合基因型GG及聯(lián)合突變基因型(AG+GG)均能增加食管鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，其OR(95％CI)分別為1.80(1.30,2.49)、2.80(1.45,5.39)、1.92(1.41,2.62)。rs2274224位點(diǎn)突變雜合基因型CG能降低食管鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR:0.65，95％CI:0.46-0.91)。單體型Grs17417407Ars2274223Crs2274224可降低食管鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR:0

7、.76，95％CI:0.62-0.93)，同時(shí)，單體型Grs17417407Grs2274223Crs2274224、Trs17417407Grs2274223Crs2274224均可增加食管鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，其OR(95％CI)分別為1.75(1.33，2.18)、2.51(1.15，5.49)?；?環(huán)境交互作用分析顯示，最優(yōu)模型為rs2274223、rs2274224、腫瘤家族史及吸煙四因素的交互。該模型交叉驗(yàn)證的統(tǒng)計(jì)量及其對(duì)應(yīng)值分

8、別為訓(xùn)練集平均精度:0.66、測(cè)試集平均精度:0.58、十重交叉驗(yàn)證的一致率（比值）為7∶10。結(jié)果表明，在該模型中“高?！比巳菏彻荀[癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是“低?！比巳旱?.67倍(OR:3.67，95％CI:2.74-4.92)。
　　 結(jié)論:
　　 PLCE1基因rs2274223位點(diǎn)的多態(tài)性與中國(guó)中部漢族人群食管鱗癌發(fā)病有關(guān)，等位基因G能增加食管鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。rs2274224位點(diǎn)的多態(tài)性與中國(guó)中部漢族人群的食管鱗癌發(fā)病