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文檔簡介
1、目的:本研究皆在探討人磷脂酶Cεl(Phospholipase C epsilon-1,PLCE1)基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)兩位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide ploymorphisms,SNP)與結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)的關(guān)聯(lián)關(guān)系,為結(jié)直腸癌高危人群篩查預(yù)警,早期診治及個(gè)體化預(yù)防等策略提供一定的遺傳學(xué)依據(jù)。
方法:通過病例-對(duì)照研究
2、方法收集2012年2月-2015年2月間就診于我院的240例CRC患者的病例資料(其中直腸癌138例,結(jié)腸癌102例),并作為病例組,同時(shí)收集同期就診于我院和147例健康人群資料,作為對(duì)照組;記錄所有研究對(duì)象的年齡、性別、吸煙史、飲酒史及腫瘤家族史等信息;通過蛋白酶K法提取研究對(duì)象白細(xì)胞中的DNA,采用PCR-LDR法對(duì)樣本基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)兩位點(diǎn)進(jìn)行基因型及等位基因分析,分別比較兩個(gè)SNP
3、位點(diǎn)不同等位基因及基因分型與CRC關(guān)聯(lián)關(guān)系。
應(yīng)用SPSS17.0軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,采用x2對(duì)兩組研究對(duì)象進(jìn)行Hardy-Weinberg均衡性檢驗(yàn),以確定病例組與對(duì)照組之間有無選擇性差異。采用x2檢驗(yàn)及t檢驗(yàn)對(duì)兩組研究對(duì)象的人口學(xué)資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用x2檢驗(yàn)對(duì)兩組之間的基因型和等位基因型分布分別進(jìn)行比較分析,采用EH軟件和2LD軟件對(duì)兩組研究對(duì)象進(jìn)行單體型頻率和連鎖不平衡分析。應(yīng)用非條件Logistic回歸法計(jì)算表示
4、相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。檢驗(yàn)顯著性水準(zhǔn)取a=0.05,P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
結(jié)果:
1、PLCE1基因rs2274223(A/G)等位基因有(AA、AG、GG)三種分型,rs17417407(G/T)等位基因有GG、GT、TT三種分型。對(duì)照組中兩個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率分布都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
5、
2、PLCE1基因rs2274223(A/G)位點(diǎn)多態(tài)性與直腸癌關(guān)聯(lián)關(guān)系
PLCE1基因rs2274223位點(diǎn)上等位基因A和G在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為68.12%和31.88%,對(duì)照組中為78.57%和21.43%,兩組分別相比,認(rèn)為直腸癌和對(duì)照組的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。在直腸癌組中A/A、A/G、G/G和AG+GG基因型出現(xiàn)的頻率分別49.28%、36.23%、14.49%和50.72%,在正常對(duì)照組中
6、分別為61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例組與對(duì)照組中GG、AG+GG基因型分別與AA基因型相比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P分別為0.003、0.032)。攜帶GG、AG+GG基因型與直腸癌的發(fā)生有相關(guān)性(OR=3.824,95%CI=1.529-9.559; OR=1.673,95%CI=1.044-2.680)。
3、PLCE1基因rs17417407(G/T)位點(diǎn)多態(tài)性與直腸癌關(guān)聯(lián)關(guān)系:
P
7、LCE1基因rs17417407(G/T)位點(diǎn)上等位基因G和T在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為81.52%和18.48%,在正常對(duì)照組中為79.59%和20.41%,表明在直腸癌與對(duì)照組的對(duì)比中,差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);在直腸癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型頻率為69.57%、23.91%、6.52%、30.43%,對(duì)照組為64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例組與對(duì)照組中TT、GT+TT基因型分別與GG基因型
8、相比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
4、PLCE1基因rs2274223(A/G)位點(diǎn)多態(tài)性與結(jié)腸癌關(guān)聯(lián)關(guān)系
PLCE1基因rs2274223 A和G等位基因在對(duì)照組中為78.57%和21.43%,結(jié)腸癌組中的頻率70.10%和29.90%,兩組相比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。在結(jié)腸癌組中基因型A/A、A/G、G/G和AG+GG的頻率為:49.02%、42.16%、8.82%和50.98%,在對(duì)照
9、組中為:61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例組與對(duì)照組中AG+GG基因型分別與AA基因型相比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。攜帶AG+GG基因型與結(jié)腸癌的發(fā)生有相關(guān)性(OR=1.690,95%CI=1.013-2.818)。
5、PLCE1基因rs17417407(G/T)位點(diǎn)多態(tài)性與結(jié)腸癌關(guān)聯(lián)關(guān)系
PLCE1基因rs17417407(G/T)位點(diǎn)上等位基因G和T在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為76
10、.47%和23.53%,在正常對(duì)照組中為79.59%和20.41%,表明在結(jié)腸癌與對(duì)照組的對(duì)比中,差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);在結(jié)腸癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型出現(xiàn)的頻率分別為62.75%、27.45%、9.80%、37.25%,在正常對(duì)照組中則為64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例組與對(duì)照組中TT、GT+TT基因型分別與GG基因型相比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),
6、PLCE
11、1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)兩SNP s位點(diǎn)聯(lián)合分析
采用EH軟件和2LD軟件對(duì)直腸癌組和結(jié)腸癌組分別與對(duì)照組中PLCE1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)兩SNP s位點(diǎn)進(jìn)行聯(lián)合分析。顯示PLCE1基因兩SNP s位點(diǎn)在直腸癌組與對(duì)照組之間存在著連鎖不平衡(D'=0.119),人群中單體型rs2274223 G-rs17417407T增加直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(O
12、R=2.413,95%CI=1.279~3.819);單體型rs2274223G-rs17417407G增加結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.130,95%CI=1.052~2.425),而rs2274223 G-rs17417407T單體型降低結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.837,95%CI=0.536~0.934)。其他單體型與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能無關(guān)。
結(jié)論:
1、PLCE1基因rs2274223(A/G) SNP可能
13、與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),攜帶AG+GG基因型增加了CRC的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn);攜帶等位基因G可能是中國北方人CRC發(fā)病的一個(gè)易感基因標(biāo)志。
2、PLCE1基因rs17417407(G/T) SNP與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。
3、PLCE1基因兩SNPs位點(diǎn)在直腸癌組和結(jié)腸癌組均與對(duì)照組之間連鎖不平衡(D'=0.119),人群中單體型rs2274223G-rs17417407T增加了直腸癌個(gè)體的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn);rs2274223G-rs
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