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1、目的:應(yīng)用焦磷酸測(cè)序法檢測(cè)晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者血漿和腫瘤組織中EGFR和KRAS基因突變狀況,分析血漿樣本是否可作為腫瘤組織的良好替代;研究NSCLC患者血漿EGFR和KRAS基因突變與表皮生長(zhǎng)因子受體酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKI)治療療效的關(guān)系;分析NSCLC患者血漿EGFR和KRAS基因突變與臨床預(yù)后的關(guān)系。
方法:收集晚期NSCLC患者的外周血樣本146例、組織樣本64例,其中血漿與組織配對(duì)者共4
2、0例。采用巢式PCR法擴(kuò)增KRAS基因第2外顯子,酶切富集PCR(ME-PCR)擴(kuò)增血漿EGFR基因的19、20和21外顯子,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行焦磷酸測(cè)序。并進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析。
結(jié)果:
1.64例晚期NSCLC腫瘤組織中檢測(cè)到EGFR基因突變22例,突變率為34.38%;KRAS基因突變3例,突變率為4.69%。
2.對(duì)99例晚期NSCLC血漿樣本進(jìn)行了EGFR基因檢測(cè),發(fā)現(xiàn)E
3、GFR基因突變24例,突變率為24.24%(24/99),與組織樣本EGFR基因突變率相比,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.16)。對(duì)全部146例晚期NSCLC血漿樣本進(jìn)行了KRAS基因檢測(cè),發(fā)現(xiàn)KRAS基因突變9例,突變率為6.16%(9/146),與組織樣本KRAS基因突變率相比,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.919)。
3.對(duì)40例血漿和組織配對(duì)樣本進(jìn)行基因檢測(cè),發(fā)現(xiàn)組織EGFR突變15例,血漿EGFR突變13例,其中11例突變?cè)诮M織
4、和血漿中同時(shí)檢測(cè)到,兩種樣本EGFR基因檢測(cè)的一致性為85.0%(34/40)。以組織基因檢測(cè)為金標(biāo)準(zhǔn),血漿EGFR突變檢測(cè)的靈敏度為73.33%(11/15),特異度為92%(23/25)。在40例組織中檢測(cè)到KRAS突變1例,配對(duì)的血漿中未檢測(cè)到KRAS突變。血漿和組織中KRAS基因突變檢測(cè)一致性為97.5%(39/40)。
4.晚期NSCLC腫瘤組織和血漿中EGFR突變與臨床病理特征的關(guān)系:晚期NSCLC患者組織中的
5、EGFR突變與吸煙史、腫瘤類型間有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。非吸煙患者EGFR突變率明顯高于吸煙患者(P=0.013),腺癌中EGFR突變率明顯高于非腺癌(P=0.022)。女性患者的EGFR突變率(47.83%)高于男性(26.839%),統(tǒng)計(jì)學(xué)差異不甚明顯(P=0.09)。但組織EGFR突變率與年齡(P=0.913)、PS評(píng)分(P=0.702)、臨床分期(P=0.164)間均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。晚期NSCLC患者血漿中EGFR基因突變與年齡、性別、
6、腫瘤類型、分期、吸煙史、PS評(píng)分的相關(guān)性分析中均未發(fā)現(xiàn)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。
5.晚期NSCLC腫瘤組織和血漿中KRAS檢測(cè)與臨床病理特征的關(guān)系:晚期NSCLC患者腫瘤組織和血漿中KRAS基因突變與年齡、性別、腫瘤類型、分期、吸煙史、PS評(píng)分的相關(guān)性分析中均未發(fā)現(xiàn)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。
6.接受TKI治療的患者共有38例,血漿EGFR突變者的疾病控制率(DCR)和客觀緩解率(ORR)分別為
7、90%(9/10)和60%(6/10),EGFR野生型患者的DCR和ORR分別為(53.57%,15/28)和(17.86%,5/28)。血漿EGFR基因是否突變,與TKI治療療效有關(guān)(DCR,P=0.059;ORR,P=0.019)。
7.接受TKI治療的患者中,血漿KRAS野生型患者的DCR和ORR(66.67%,22/33;33.33%,11/33)高于KRAS突變患者(40%,2/5;0%,0/5)。但統(tǒng)計(jì)學(xué)差異不
8、明顯(DCR,P=0.337;ORR,P=0.295)。
8.接受TKI治療的患者,總體中位PFS為6個(gè)月,EGFR基因19和21外顯子突變的患者中位PFS為10.5個(gè)月,較EGFR野生型患者的中位PFS(5.1個(gè)月)顯著延長(zhǎng),但統(tǒng)計(jì)學(xué)意義不明顯(P=0.228)。KRAS突變的患者病情進(jìn)展較快,其中位PFS僅為2.5個(gè)月,明顯小于KRAS野生型患者的PFS(9個(gè)月),兩組患者PFS具有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0)。
9、 結(jié)論:
1、晚期NSCLC血漿和組織中EGFR和KRAS基因突變具有高度的一致性,血漿樣本可以作為組織樣本的良好替代。
2、焦磷酸測(cè)序技術(shù)具有操作簡(jiǎn)便、高通量檢測(cè)的特點(diǎn),與ME-PCR的結(jié)合可有效富集突變型EGFR基因,可以準(zhǔn)確檢測(cè)出血漿EGFR和KRAS基因突變,可用于篩選適合TKI治療的NSCLC患者,有利于指導(dǎo)NSCLC患者的個(gè)體化用藥。
3、晚期NSCLC組織中EGFR突變更多見(jiàn)于
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