過氧化物酶體增殖物激活受體天然泛激動劑的虛擬篩選.pdf

1、本研究主要采用分子對接和分子動力學模擬的方法，結合中藥對Ⅱ型糖尿病及高血脂等疾病的治療效果，從已解析出結構的天然中藥中選取以黃酮類化合物為主的38種中藥成份，篩選過氧化物酶體增殖物激活受體的天然泛激動劑，以探索中藥化合物治療Ⅱ型糖尿病及高脂血癥的機理，為中藥在分子水平上治療疾病提供理論依據(jù)。通過實驗可知，姜黃素、白藜蘆醇、漢黃芩素、黃芩苷元、大豆黃素代謝產(chǎn)物Ⅲ和Ⅳ六種物質(zhì)與過氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型對接后都在AF2、helix3

2、、helix7、helix10及4個β-sheet所形成的疏水性活性腔中。因此，它們可作為過氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型潛在的天然泛激動劑。
　　 選取其中的一個化合物漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型的對接復合物進行分子動力學模擬，研究配體與過氧化物酶體增殖物激活受體三種蛋白質(zhì)間的相互作用機理。結果表明：漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體三個亞型對接后，都處于AF2、helix3、helix7、helix10與

3、4個β-sheet之間形成的一個疏水位置。同時對漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型間的氫鍵、疏水及靜電相互作用進行分析的結果表明：漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體α、δ之間沒有氫鍵形成，僅有過氧化物酶體增殖物激活受體γ的Ser289和漢黃芩素苯環(huán)上的羥基之間形成了氫鍵；漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體三種蛋白質(zhì)活性腔存在較弱的疏水作用；另外，漢黃芩素與過氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型蛋白之間的靜電作用很強。因此，漢黃