花尾榛雞的系統(tǒng)地位與BLB基因多態(tài)性研究.pdf

1、花尾榛雞(Tetrastes bonasia)是松雞科鳥類中分布最廣、最為常見的一個(gè)種?；ㄎ查浑u的分類地位一直存在爭(zhēng)議，目前，從分子水平上專門對(duì)花尾榛雞系統(tǒng)地位的研究還未見報(bào)道。花尾榛雞由于肉味鮮美深得人們青睞，因野生數(shù)量減少已被列為國(guó)家二級(jí)保護(hù)動(dòng)物，但其人工馴養(yǎng)繁殖中存在繁殖率低、幼雛成活率低和對(duì)疾病的易感性等問題，而MHC基因與抗病性和繁殖力都有很大的相關(guān)性，因此，對(duì)花尾榛雞BLB基因多態(tài)性進(jìn)行研究必要而可行。
　　本研究首先

2、通過實(shí)驗(yàn)獲得花尾榛雞和黑琴雞的COⅠ序列，并從Genbank中下載松雞科17個(gè)物種的12S rRNA、Cytb、ND2序列和13個(gè)物種的COⅠ序列，通過單基因和多基因整合序列從分子水平探討花尾榛雞的系統(tǒng)地位。其次，對(duì)花尾榛雞33個(gè)個(gè)體BLB基因的exon2進(jìn)行PCR擴(kuò)增，采用克隆測(cè)序的方法進(jìn)行序列測(cè)定，并利用生物軟件對(duì)所獲得的核苷酸序列進(jìn)行分析，結(jié)果如下:
　　1、依據(jù)12S rRNA、Cytb和COⅠ基因序列和四個(gè)基因的整合序列

3、的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果，本研究支持將花尾榛雞劃入松雞科(Tetraonidae)榛雞屬(Tetrastes)，即支持Tetrastes屬有效。
　　2、對(duì)比單基因和整合數(shù)據(jù)的結(jié)果，所選擇的4個(gè)基因中，COⅠ基因更適合松雞科鳥類的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系研究。
　　3、從33個(gè)個(gè)體中得到234條克隆序列，比對(duì)分析后得到13個(gè)等位基因序列。核苷酸突變分析表明，花尾榛雞13個(gè)BLB等位基因的突變主要以顛換為主。平均非同義替換率dn(0.111)與

4、平均同義替換率ds(0.096)的比值為1.156，大于1，表現(xiàn)為正向選擇。
　　4、利用BLB外顯子2序列對(duì)花尾榛雞種群進(jìn)行遺傳多樣性分析，結(jié)果顯示，該種群的遺傳多樣性偏低，暗示該物種的抗病能力較弱。
　　5、根據(jù)進(jìn)化樹、Network網(wǎng)絡(luò)圖以及個(gè)體基因型顯示，花尾榛雞可能存在至少3個(gè)BLB座位;在鳥類MHC的BLB中存在著基因重復(fù)事件。
　　6、構(gòu)建的雞形目10種鳥類的BLB進(jìn)化樹顯示，所分析雉科中紅腹錦雞和環(huán)頸雉