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文檔簡介
1、目的:1.以IL8、IL8RA、IL8RB作為候選基因,在中國北方漢族人群中篩查其單核苷酸多態(tài)的分布及頻率,建立三個(gè)基因的單核苷酸多態(tài)(SNPs)系統(tǒng)目錄。2.選擇具有代表性的SNPs位點(diǎn),并在病例/對照中分型,探討IL8、IL8RA、IL8RB基因變異和冠心?。–HD)發(fā)病的相關(guān)性。探討三個(gè)基因的SNPs及單體型能否增加CHD的發(fā)病危險(xiǎn),為CHD早期診治和個(gè)體化的預(yù)防研究提供有價(jià)值的遺傳學(xué)依據(jù)。 方法:本課題采用病例對照研究,
2、應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)技術(shù)(PCR-RFLP)、DNA測序?yàn)檠芯渴侄危灾袊狈降貐^(qū)漢族人群為研究對象,篩查IL8、IL8RA、IL8RB SNPs的分布,基因型和等位基因頻率,以建立3個(gè)白介素基因的SNPs系統(tǒng)目錄。 用于SNPs篩查的DNA樣本隨機(jī)選自沈陽軍區(qū)總醫(yī)院心內(nèi)科住院的無親緣關(guān)系的中國北方漢族48個(gè)個(gè)體。利用基因組DNA直接測序的方法篩查IL8、IL8RA、IL8RB基因的5’區(qū)(2kb以內(nèi))、5'UT
3、R、編碼區(qū)、外顯子相鄰的部分內(nèi)含子、3' UTR與和3’區(qū)(2kb以內(nèi))。然后在412例研究對象中,以PCR-RFLP和直接測序方法鑒定所選SNPs的基因型。SPSS軟件分析在CHD組和對照組中的差異,二項(xiàng)式Logistic回歸分析用于檢驗(yàn)多態(tài)位點(diǎn)與CHD的獨(dú)立關(guān)聯(lián)。 結(jié)果:1.9253bp的測序范圍內(nèi)共發(fā)現(xiàn)10個(gè)SNP位點(diǎn),其中1個(gè)為首次報(bào)道。2.IL8基因+394G/T的基因型在CHD組與對照組間分布頻率沒有顯著性差異(P>
4、0.05),但兩組間G、T等位基因頻率在兩組間分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。IL8基因+781C/T多態(tài)基因型和等位基因頻率在CHD組與對照組間分布頻率有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.035;P=0.037)。二項(xiàng)式Logistic回歸校正年齡、吸煙、高血壓、糖尿病、CHD家族史等CHD危險(xiǎn)因素后,IL8基因+394G/T多態(tài)等位基因頻率和+781C/T多態(tài)基因型和等位基因頻率在CHD組與對照組分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。IL8
5、基因-251A/T和IL8RB+1235T/C多態(tài)基因型和等位基因頻率在CHD組和對照組人群中分布的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。3.連鎖不平衡和單體型檢驗(yàn)顯示:在本研究的人群中存在AGC、AGT、ATC、ATT、TGC、TGT、TTC、TTT八種單體型,所有單體型在CHD組和對照組的分布頻率無顯著差異。 結(jié)論:IL8基因+394G/T、+781C/T多態(tài)可能是中國北方漢族人群CHD發(fā)病的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。IL8基因-251A/
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