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文檔簡(jiǎn)介
1、背景:心肌梗死(Myocardial infarction,MI)是世界范圍內(nèi)最主要的死亡原因之一,約90%的心肌梗死是由動(dòng)脈粥樣斑塊破裂并繼發(fā)血栓形成導(dǎo)致冠狀動(dòng)脈急性阻塞所引起的。動(dòng)脈血栓形成是MI病理過程中最主要的致病環(huán)節(jié)之一。纖維蛋白原是一種急性期蛋白,它由肝臟合成。當(dāng)機(jī)體處于感染狀態(tài)時(shí),血漿中的纖維蛋白原水平會(huì)顯著增高。纖維蛋白原作為血栓形成過程中凝血作用激活的最后一個(gè)靶點(diǎn),通過聚集血小板和促進(jìn)纖維斑塊的形成,在血栓形成和延展過
2、程中起到十分關(guān)鍵的作用,在歐美及日本等國家所進(jìn)行的流行病學(xué)研究也已證實(shí)血漿纖維蛋白原水平與纖維蛋白原基因變異均和MI相關(guān)。由于纖維蛋白原β鏈(Fibrinogen β-chain)的合成是纖維蛋白原合成的限速步驟,因此,纖維蛋白原β鏈(Fibrinogen β-chain,F(xiàn)GB)基因變異被科學(xué)家們大量關(guān)注。既往的研究中已發(fā)現(xiàn)FGB基因-455G/A、-148C/T等多態(tài)與MI相關(guān),但這種關(guān)聯(lián)也可能是這些位點(diǎn)與功能性多態(tài)連鎖不平衡所造成
3、的。因此,我們考慮采用候選基因途徑基因組掃描策略,系統(tǒng)篩查中國北方漢族人群FGB基因編碼區(qū)和側(cè)翼序列,識(shí)別所有多態(tài)位點(diǎn),并進(jìn)一步在病例-對(duì)照研究中探討潛在的功能多態(tài)位點(diǎn)與MI的關(guān)系。 材料和方法:選取1997年10月至2000年9月期間阜外心血管病醫(yī)院病房收治的北京地區(qū)漢族急性MI后存活的患者509例;選擇年齡、性別與病例匹配的北京社區(qū)人群507例作為對(duì)照組。對(duì)每一個(gè)參加者均詳細(xì)填寫調(diào)查表,包括疾病個(gè)人史、家族史、吸煙與飲酒史和
4、藥物使用情況,并測(cè)量血壓、身高、體重、腰圍及臀圍等,計(jì)算體重指數(shù)和腰臀比值,測(cè)定脂質(zhì)等生化指標(biāo)。為研究FGB基因序列中是否存在未知的功能性多態(tài)位點(diǎn),我們先在病例人群中隨機(jī)選取48例樣本,利用基因組DNA直接測(cè)序篩查出基因編碼區(qū)及部分調(diào)節(jié)區(qū)的全部序列變異;然后根據(jù)既往研究熱點(diǎn)及測(cè)序所獲得結(jié)果,分別在啟動(dòng)子區(qū)、編碼區(qū)及3’側(cè)翼序列各選擇1個(gè)頻率大于5%的多態(tài)位點(diǎn),在全部個(gè)體中應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片斷長(zhǎng)度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)方法
5、進(jìn)行基因型鑒定。方差分析及χ2檢驗(yàn)用于單變量分析,多元非條件Logistic回歸分析用于檢驗(yàn)多態(tài)位點(diǎn)與疾病的獨(dú)立關(guān)聯(lián)及與環(huán)境因素的交互作用。用2LD程序計(jì)算連鎖不平衡系數(shù),EH程序估計(jì)單體型頻率,Haplo.score程序檢驗(yàn)單體型與疾病的獨(dú)立關(guān)聯(lián),Haplo.glm程序檢驗(yàn)單體型和環(huán)境因素的交互作用。結(jié)果:1.我們?cè)贔GB基因5.7 kb的測(cè)序范圍內(nèi)共發(fā)現(xiàn)18個(gè)多態(tài)位點(diǎn),均為單核苷酸多態(tài)(SNP)。其中有6個(gè)SNP為首次報(bào)道,它們是位
6、于內(nèi)含子4中的5092G/A、內(nèi)含子6中的6493T/C和6401G/A、編碼區(qū)的3501G/A(Cys111Tyr)、6264A/T(Asn309Tyr)和位于3’側(cè)翼序列的8588G/A,但后三個(gè)多態(tài)在我們的研究人群中少見等位基因頻率較低。2.研究最多的啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)-455G/A和R448K等在國人中的頻率和高加索人群相似(均≈20%)。3.基因內(nèi)部常見的多態(tài)間存在緊密連鎖不平衡。4.單變量分析提示在顯性、隱性及加性三種模式下,-4
7、55G/A、R448K和8558C/G三個(gè)多態(tài)均與MI關(guān)聯(lián)。但調(diào)整了其它傳統(tǒng)的心血管病危險(xiǎn)因素后,只有R448K在顯性模型下(RK+KK:RR,OR=0.71,P=0.026)及8558C/G在隱性模型下(GG:GC+CC,OR=0.28,P=0.046)仍然與MI保持顯著關(guān)聯(lián)。5.連鎖不平衡和單體型分析顯示,-455G/A、R448K和8558C/G三個(gè)多態(tài)間存在幾乎完全的連鎖不平衡,并主要組成兩種相對(duì)立的單體型-455G-448R-
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