渝西烏雞產(chǎn)蛋性能的微衛(wèi)星和RAPD標(biāo)記研究.pdf

1、渝西烏雞是優(yōu)質(zhì)肉雞新品系，但種雞產(chǎn)蛋率低，在選育具有良好的產(chǎn)肉性能的種雞時(shí)，適當(dāng)提高產(chǎn)蛋率，可以提高種雞繁殖性能和經(jīng)濟(jì)效益。傳統(tǒng)的利用表型值的選育方法花費(fèi)大，受環(huán)境影響大，而分子標(biāo)記不僅不受環(huán)境的影響，通常為共顯性，還能對數(shù)量性狀位點(diǎn)進(jìn)行連鎖分析。隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA，RAPD)和微衛(wèi)星分析是目前常用的尋找分子遺傳標(biāo)記的兩種方法。 本研究用微衛(wèi)星和RAPD兩種方法，對渝

2、西烏雞慢羽系180個(gè)個(gè)體的基因組DNA進(jìn)行分析，并采用最小二乘法將微衛(wèi)星和RAPD分析結(jié)果與試驗(yàn)雞的產(chǎn)蛋性能進(jìn)行相關(guān)分析，期望找到適合該品種選育用的分子標(biāo)記。 首先對影響RAPD擴(kuò)增條件的主要因素進(jìn)行優(yōu)化。通過正交試驗(yàn)，探索擴(kuò)增反應(yīng)的最適條件，考查的因素為Mg2+終濃度、退火溫度、延伸時(shí)間和循環(huán)次數(shù)，每個(gè)因素3個(gè)水平。分別以15份渝西烏雞基因組DNA為模版，對所有26個(gè)隨機(jī)引物的擴(kuò)增條件進(jìn)行篩選，以擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳出現(xiàn)清

3、晰可辨認(rèn)條帶為最適擴(kuò)增條件。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，10個(gè)隨機(jī)引物能夠擴(kuò)增出合適片段大小(100-2000bp)的條帶，其中，5個(gè)隨機(jī)引物的擴(kuò)增產(chǎn)物具有多態(tài)性。 用出現(xiàn)多態(tài)性條帶的5個(gè)隨機(jī)引物對全部180只渝西烏雞進(jìn)行RAPD分析，分別計(jì)算遺傳相似系數(shù)與遺傳多樣性指數(shù)，判斷渝西烏雞群體的整齊度。根據(jù)各引物多態(tài)性條帶的有無將180只雞分為兩組，用最小二乘法對兩組雞的生產(chǎn)性能進(jìn)行比較。結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)與產(chǎn)蛋率有關(guān)的條帶，但發(fā)現(xiàn)條帶S87-Ⅲ與條帶S9

4、8-Ⅰ與蛋重顯著相關(guān)(P＜0.05)。 根據(jù)5個(gè)多態(tài)性隨機(jī)引物的擴(kuò)增結(jié)果，分別對180只雞RAPD標(biāo)記進(jìn)行基因型的分型。S108標(biāo)記因有3個(gè)基因型僅出現(xiàn)一個(gè)個(gè)體，不能做最小二乘分析。其余4個(gè)隨機(jī)引物各基因型雞的產(chǎn)蛋性能用最小二乘法進(jìn)行比較，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，各基因型雞的產(chǎn)蛋率、蛋重和體重等的最小二乘均值間均存在顯著差異。其中，S87標(biāo)記B型與F型雞的產(chǎn)蛋率差異顯著(P＜0.05)，C、E與F型雞的蛋重差異極顯著(P＜0.01)；S98標(biāo)

5、記D、F、L型與E型雞的產(chǎn)蛋率差異顯著(P＜0.05)，E與H型雞的蛋重差異顯著(P＜0.05)；S102標(biāo)記的G與D型雞的蛋重差異顯著(P＜0.05)；S113標(biāo)記G、F型雞的產(chǎn)蛋率顯著低于A型(P＜0.05)，D型雞的產(chǎn)蛋率極顯著的低于A型雞(P＜0.01)。 用2個(gè)選自家禽基因組的微衛(wèi)星對180個(gè)試驗(yàn)個(gè)體進(jìn)行分析，通過聚丙烯酰胺凝膠電泳發(fā)現(xiàn)，2個(gè)微衛(wèi)星的擴(kuò)增產(chǎn)物均表現(xiàn)出豐富的多態(tài)性。等位基因數(shù)分別為4個(gè)和5個(gè)，雜合度為0.

6、7422和0.7914，多態(tài)信息含量分別為0.6467和0.7648。通過最小二乘分析法對微衛(wèi)星與產(chǎn)蛋性能的相關(guān)分析結(jié)果表明，兩個(gè)微衛(wèi)星的不同基因型雞的產(chǎn)蛋性能最小二乘均值間差異不顯著(P＞0.05)。 綜上所述，RAPD條帶S87-Ⅱ和S98-Ⅰ很有可能可以作為渝西烏雞蛋重選育的分子標(biāo)記；S87標(biāo)記B型雞與C型雞、S102標(biāo)記G型雞與可能可以作為產(chǎn)蛋性能優(yōu)良渝西烏雞個(gè)體選留做種用，這些標(biāo)記是否可以作為分子標(biāo)記對渝西烏雞進(jìn)行選育