應(yīng)用寡核苷酸芯片檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌遺傳易感相關(guān)的代謝酶基因多態(tài)性.pdf

1、山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文應(yīng)用寡核苷酸芯片檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌遺傳易感相關(guān)的代謝酶基因多態(tài)性姓名：劉群申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：腫瘤學(xué)指導(dǎo)教師：王哲海20080301山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文國(guó)內(nèi)外大量研究運(yùn)用DNA澳fJ序法、聚合酶鏈一限制性長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR—RFLP)等方法檢測(cè)這些代謝酶基因的SNP，進(jìn)而分析它們與NSCLC易感性的關(guān)系。近年來(lái)芯片技術(shù)以其快速、高效、并行、高通量等優(yōu)點(diǎn)逐漸應(yīng)用于多基因多位點(diǎn)SNP的檢測(cè)。本研究采用寡

2、核苷酸芯片技術(shù)檢澳dNSCLC患者代謝酶基因CYPlAlml、m2位點(diǎn)和GSTMl的基因多態(tài)性，通過(guò)DNA測(cè)序驗(yàn)證該技術(shù)用于檢i貝tJSNP的可行性；并分析這三種SNP與NSCLC易感性的關(guān)系及它們與環(huán)境因素之間、多SNP之間的相互聯(lián)系。方法2006年1月至2007年5月，病例組為山東省腫瘤醫(yī)院就診的NSCLC患者110例，均經(jīng)細(xì)胞學(xué)或組織病理學(xué)確診且未經(jīng)放射、化學(xué)治療，其中鱗癌68例(618％)，腺癌31例(282％)，其他類型1l例

3、(10％)，中位年齡581歲。對(duì)照組為醫(yī)院健康體檢者125例，中位年齡592歲。兩組均為山東漢族人，性別、年齡采用頻數(shù)配對(duì)，并以問(wèn)卷形式收集研究對(duì)象的人口學(xué)資料、吸煙史、職業(yè)史等。采集2組外周血標(biāo)本2ml，應(yīng)用Fastagen公司血標(biāo)本DNA提取試劑盒按照操作步驟提取外周血DNA。根據(jù)Genebank數(shù)據(jù)庫(kù)的序列資源設(shè)計(jì)寡核苷酸探針，制備芯片，將提取的DNA通過(guò)PCR擴(kuò)增出靶序列與芯片雜交，通過(guò)Scanarray4000掃描并讀取雜交結(jié)

4、果。利用DNA測(cè)序法鑒定芯片的檢測(cè)結(jié)果。應(yīng)用SPSSl30軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析，以)C2檢驗(yàn)對(duì)不同基因型之間的差異進(jìn)行分析，用非條件Logistic回歸模型計(jì)算比值比(oddsratios，OR)及其95％可信區(qū)間(confidenceintervals，CI)，全部檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)，P005)。31lO例NSCLC中，CYPIAI基因m2位點(diǎn)IIe／IIe、IIe／Val和Val／Val基因型分布頻率為1636％、7273％和i091