系統(tǒng)性紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞基因表達(dá)模式.pdf

1、本研究分為二部分：
　　 第一部分:系統(tǒng)性紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞基因表達(dá)系列分析文庫的生物信息學(xué)分析
　　 目的:分析已構(gòu)建的系統(tǒng)性紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞基因表達(dá)系列分析文庫，勾畫系統(tǒng)紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞的基因表達(dá)模式。
　　 方法:利用SAGE 2000V 4.5對已建立的SAGE文庫產(chǎn)生的測序文件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,上傳SLE 患者20個高表達(dá)基因到http://david.niaid.nih.gov/da

2、vid/ease.htm，得到基因的功能注釋，利用卡方檢驗(yàn)篩選表達(dá)差異的基因。
　　 結(jié)果:文庫測序共1814個SAGE標(biāo)簽（tag），由1286 序列不同的tag組成。這些tag中，單拷貝tag 占86.6%，僅0.2%tag 多于20 拷貝。與已知表達(dá)序列相配的tag 占68.4%，其中41.1%的tag 能與多個表達(dá)序列匹配；31.6%的tag不能和已知表達(dá)序列配對，它們可能代表新基因。20個高表達(dá)基因與正常人文庫比較發(fā)現(xiàn)

3、3個差異表達(dá)的基因。
　　 結(jié)論:研究勾畫出系統(tǒng)性紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞基因表達(dá)概貌。通過對比分析正常人和SLE 患者的SAGE 文庫的生物學(xué)信息，將有助于我們了解系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病機(jī)制。
　　 第二部分：RT-PCR驗(yàn)證系統(tǒng)性紅斑狼瘡?fù)庵苎獑蝹€核細(xì)胞SAGE 文庫中神經(jīng)顆粒素的差異表達(dá)
　　 目的:測定神經(jīng)顆粒素在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和正常人中的表達(dá)情況。
　　 方法:SAGE 生物學(xué)分析。RT-P

4、CR的方法驗(yàn)證35例系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和15例正常人神經(jīng)顆粒素mRNA表達(dá)水平，分析神經(jīng)顆粒素mRNA表達(dá)水平與SLE活動性指數(shù)（SLEDAI）相關(guān)性。
　　 結(jié)果:比較系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和正常人SAGE 文庫篩選出差異表達(dá)基因神經(jīng)顆粒素，活動期SLE 神經(jīng)顆粒素mRNA水平高于緩解期（p<0.05）及正常對照組（p<0.001），緩解期高于正常對照組（p<0.05）。系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者Ng mRNA 水平與SLEDAI 正相關(guān)