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文檔簡介
1、本研究以額爾齊斯河貝加爾雅羅魚(Leuciscus leuciscus baicalensis)為實驗對象,聯(lián)合二代測序技術和熒光毛細管電泳技術,開發(fā)微衛(wèi)星位點30個,其中19個來自基因組,11個來自轉錄組;利用這30個位點對哈巴河、布爾津及北灣三個群體進行遺傳多樣性分析,并探究這些位點在其他9種鯉科魚類中的通用性。主要結果如下:
1.共合成160對引物,64對來自基因組,96對來自轉錄組;在擴增(以北灣群體樣品為模板)過程中
2、出現(xiàn)不同程度的擴增失敗:3對基因組微衛(wèi)星引物和25對轉錄組微衛(wèi)星引物未擴增出任何條帶或者未得到目的條帶。
2.用30個微衛(wèi)星標記評估北灣、布爾津和哈巴河三個群體的遺傳多樣性,共檢測出等位基因339個,各位點等位基因數范圍在4-27之間,平均11.3個;有效等位基因數一共154.28個,介于1.56-15.34之間,平均5.14個;觀測雜合度在0.37-1.00之間,平均值是0.68;期望雜合度在0.36-0.94,平均值是0.
3、75;多態(tài)性信息含量在0.31-0.93之間,平均值是0.71。
3.遺傳分化指數和遺傳距離顯示,三個群體沒有發(fā)生顯著分化;分子方差分析結果顯示,大部分變異來自個體間,極少數變異來自種群間。
4.位點多態(tài)性比例:基因組31.1%,轉錄組15.5%;用于遺傳多樣性評估的指數,基因組微衛(wèi)星位點的指數均大于轉錄組SSR微衛(wèi)星的指數。
5.30個位點在擬鯉中的通用率最高,為80%,其次是高體雅羅魚,為76.7%;轉
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