
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1、肝臟有重要的生理功能和很強(qiáng)的再生能力。在物理、化學(xué)、生物等因素誘導(dǎo)下,殘肝細(xì)胞進(jìn)行增生以補(bǔ)償丟失的肝組織和恢復(fù)肝臟的生物學(xué)功能,此過(guò)程稱(chēng)為肝再生(liver regeneration,LR)。研究表明,肝再生涉及細(xì)胞激活、去分化、細(xì)胞增殖及調(diào)控、再分化、組織結(jié)構(gòu)和功能重建等生理活動(dòng),以及組織和細(xì)胞形態(tài)、結(jié)構(gòu)的一系列變化。另一方面,核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)信號(hào)通路參與調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖、細(xì)胞
2、發(fā)育等重要生理活動(dòng)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。為了從基因組轉(zhuǎn)錄水平了解其在大鼠肝再生中對(duì)肝細(xì)胞增殖的調(diào)控作用。本文用大鼠全基因組表達(dá)譜芯片RatGenome2302.O檢測(cè)NF-κB信號(hào)通路、細(xì)胞增殖、NF-κB信號(hào)通路調(diào)節(jié)的細(xì)胞增殖相關(guān)基因,用RT-PCR確證芯片檢測(cè)結(jié)果的可靠性。研究表明,NF-κB信號(hào)通路、細(xì)胞增殖和NF-κB信號(hào)通路調(diào)節(jié)的細(xì)胞增殖活動(dòng)分別包含238、1680和121個(gè)基因,Rat Genome2302.0芯片含其中的197、
3、1314和118個(gè),大鼠再生肝中的有意義表達(dá)基因個(gè)數(shù)分別是79、423和56,肝細(xì)胞中的有意義表達(dá)基因數(shù)分別是83、484和58個(gè)。另外,用BLAST軟件分析Affymetrix芯片上未知的肝再生相關(guān)基因同源性發(fā)現(xiàn),大鼠再生肝中NF-κB信號(hào)通路、細(xì)胞增殖、NF-κB信號(hào)通路調(diào)節(jié)的細(xì)胞增殖相關(guān)基因的同源新基因分別有19、86和6個(gè)。肝細(xì)胞中的同源新基因分別有21、104和11個(gè)。然后,用譜函數(shù)(Et)計(jì)算相關(guān)基因的表達(dá)變化及它們預(yù)示的細(xì)
4、胞增殖活動(dòng)表叫,在大鼠再生肝中,途徑1、12和13在大鼠肝再生起始和進(jìn)展階段以及途徑5和6在進(jìn)展階段的信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)增強(qiáng);細(xì)胞增殖和NF-κB信號(hào)通路調(diào)節(jié)的細(xì)胞增殖相關(guān)活動(dòng)亦在起始和進(jìn)展階段增強(qiáng),并與信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)正相關(guān)。在肝細(xì)胞中,途徑1在起始和進(jìn)展階段、途徑12在整個(gè)大鼠肝再生、途徑13在進(jìn)展和終止階段的信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)增強(qiáng);而肝細(xì)胞增殖和NF-κB信號(hào)通路調(diào)節(jié)的肝細(xì)胞增殖活動(dòng)在整個(gè)肝再生中都顯著性地增強(qiáng),且同樣與其信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)呈現(xiàn)正相關(guān)。
5、最后,本文又用T檢驗(yàn)(T-Statistic)方法挖掘關(guān)鍵基因和Pathway Studio7.0軟件分析其關(guān)鍵基因的作用機(jī)理表明,在大鼠再生肝中,途徑1通過(guò)關(guān)鍵基因Tnfrsf12a、途徑5和6通過(guò)關(guān)鍵基因Lbp、途徑12通過(guò)起關(guān)鍵作用的Rras2的同源基因AI548708和途徑13通過(guò)關(guān)鍵基因Cxcl16、Fgr、Cxcr4增強(qiáng)NF-κB活性,提高關(guān)鍵基因Jun、Myc、Ldha、Bc13和其他相關(guān)基因的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞增殖。在肝細(xì)胞
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