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文檔簡介
1、目的:
1、在浙江省各地區(qū)特殊教育學校、殘聯(lián)、語言康復中心、各合作醫(yī)療單位和社會單位收集非綜合征型耳聾(nonsyndromic sensorineural hearing loss,NSHL)病例臨床資料并采集患者外周血。
2、在線粒體A1555G突變?nèi)巳褐泻Y查線粒體tRNAThr和tRNAIle基因,分析篩查結(jié)果,完善浙江省藥物性非綜合征型耳聾資源庫。
3、分析一個同時攜帶有線粒體12S rRNA A1
2、555G突變和線粒體tRNAThrC15910T突變家系的臨床資料和分子遺傳學特征。
4、構建含有mt tRNATle A4317G突變和mt12S rRNA A1555G突變的永生化淋巴母細胞系(lymphoblastoid cell lines,LCLs),保存耳聾資源,同時為后續(xù)研究A4317G在耳聾中的致病機制奠定實驗基礎。
5、對LCLs進行線粒體功能實驗,初步探討線粒體tRNAIle A4317G突變對耳
3、聾表型的作用機制。
方法:
1、收集浙江省內(nèi)NSHL患者以及聽力正常的體格健康人群的臨床資料和血液樣本。對收集的臨床資料進行整理分析。收集耳聾患者外周血液樣本,提取全基因組DNA,建立浙江省耳聾人群臨床和分子流行病學調(diào)查資料數(shù)據(jù)庫。
2、通過聚合酶鏈式反應(polymerise chain reaction,PCR)技術擴增線粒體12SrRNA基因,對攜帶線粒體A1555G突變患者進一步篩查線粒體tRNAI
4、le和tRNAThr基因,對可疑位點的保守性、基因多態(tài)性以及可能造成的功能改變進行分析。
3、調(diào)查同時攜帶有線粒體12Sr RNA A1555G突變和線粒體tRNAThr C15910T突變家系(FE141)的臨床資料和遺傳學特征。
4、在以往工作基礎上,完善同時攜帶A1555G和A4317G突變的中國漢族耳聾家系(FE163)的臨床資料,分析該家系母系成員線粒體單體型、評估tRNAIle4317位點保守性以及軟件預
5、測A4317G突變對線粒體tRNAIle二級結(jié)構的作用,總體評估m(xù)t tRNAIle A4317G突變潛在的致聾基礎。
5、 EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)轉(zhuǎn)染人外周血中的B淋巴細胞(Blymphocyte cell,BLC),構建三組LCLs:同時攜帶mt12S rRNA基因A1555G突變和mt tRNAIle基因A4317G突變的東亞單體型B的NSHL耳聾患者;僅含有mt12S rRNA A15
6、55G突變且單體型為東亞單體型B的NSHL耳聾患者;無致病性mtDNA突變的東亞單體型B人群。
6、對構建的LCLs細胞的活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平、線粒體膜電位(mitochondridal membrane potential,MMP)以及細胞倍增時間(doublingtime,DT)進行測定,初步分析構建的LCLs的功能改變。
7、統(tǒng)計學軟件SPSS16.0分析LCLs
7、功能實驗結(jié)果,檢測數(shù)據(jù)是否有統(tǒng)計學差異。
結(jié)果:
1、所有A1555G突變樣本和正常對照樣本mt tRNAIle基因篩查僅發(fā)現(xiàn)A4317G突變。4317位點位于tRNAIle高度保守的T臂區(qū),位點保守性指數(shù)(ConservativeIndex,CI)為87.5%。當A4317突變?yōu)镚4317后,形成了新的C-G配對,改變了tRNAIleT臂的結(jié)構。
2、tRNAThr基因篩查發(fā)現(xiàn)T15889C、C15910
8、T、A15924G、G15927A和T15943C5個位點,其中T15943C未有文獻報道。通過分析發(fā)現(xiàn)tRNAThrC15910T和T15943C僅在NSHI患者中存在。兩個位點的保守性都極高(CI均為93.3%),很可能是與耳聾相關的繼發(fā)性突變位點。
3、線粒體12S rRNAA1555G、tRNAIleA4317G和tRNAThrC15910T突變只存在于母系成員中,父系成員及其配偶均未檢測到。
4、FE141
9、家系母系成員mtDNA全序列分析共發(fā)現(xiàn)36個位點堿基改變,tRNA基因上僅發(fā)現(xiàn)tRNAThrC15910T突變。FE141家系母系成員線粒體全序分析發(fā)現(xiàn)線粒體DNA單體型屬于東亞單體型F3b。FE163家系除A1555G突變和A4317G突變外還有36個位點堿基改變。線粒體DNA全序列分析發(fā)現(xiàn)該家系母系成員mtDNA單體型為東亞單體型B4c。
5、FE163家系LCLs細胞功能實驗發(fā)現(xiàn),與僅攜帶A1555G突變或者無突變的LC
10、Ls細胞組相比,該耳聾家系LCLs細胞ROS水平分別增加41.86%和79.07%,MMP水平分別降低36.82%和63.7%,細胞倍增時間在葡萄糖培養(yǎng)基中分別延長1.6%和71.1%,在乳糖培養(yǎng)基中分別延長0.3%和32.2%。
結(jié)論:
1、攜帶A1555G突變的耳聾人群mt tRNAIle和tRNAThr基因突變篩查發(fā)現(xiàn),其中3個突變不存在于正常人群中,推測mt tRNAIle和tRNAThr基因很可能與線粒體D
11、NA基因突變導致的NSHL有關。
2、線粒體tRNAIle基因A4317G(A59G)突變形成了新的G-C配對,改變了tRNAIle T臂的結(jié)構,可能阻止mt tRNAIle CCA-加尾,影響了其氨基?;?,導致tRNAIle結(jié)構不穩(wěn),最終可能影響蛋白的合成。線粒體tRNAThr基因15910位點在tRNAThr的D莖上,保守性指數(shù)達93.3%,在3216例對照中未發(fā)現(xiàn)該突變,是一個高度保守的位點。當15910位點的C突變
12、為T時,高度保守的C-G配對破壞,該位點的改變類似于T15908C,可能協(xié)同A1555G突變影響耳聾的表型表達。
3、線粒體A1555G突變家系母系成員耳聾臨床表型相差很多:聽力下降水平、聽力開始下降的時間以及耳聾家系發(fā)病率等方面存在明顯差異,這提示核基因及其環(huán)境因素也可能參與了耳聾的發(fā)展。
4、初步的細胞功能實驗結(jié)果證實了mt tRNAIle基因A4317G突變可能加強A1555G突變對耳聾表型的影響。但并不能完全
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