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文檔簡介
1、目的:通過對西北地區(qū)97例非綜合征型耳聾患者進行線粒體DNA全序列擴增測序,進而分析可能致聾的mtDNA突變位點。
方法:采集中國西北五省、有家族史、無親緣關(guān)系的97例中度至極重度非綜合征型耳聾先證者的血樣,并收集相關(guān)的臨床及家系資料,另外收集376例聽力正常人群作為對照組。用傳統(tǒng)酚氯仿法提取相關(guān)基因組DNA,并用24對有部分重疊的正反向引物進行線粒體DNA全序列PCR擴增,擴增后測序,對結(jié)果進行分析,查找所有的線粒體DNA突
2、變位點,確定線粒體單體型,分析突變位點保守性、突變位點的突變頻率、突變可能對基因二級結(jié)構(gòu)的影響,從而查找致聾的線粒體候選基因。
結(jié)果:1、在病例組,男女患者比例為0.9:1(46:51),平均檢測年齡為22±0.10歲,平均發(fā)病年齡3±0.83歲,聽力損失從中度到極重度不等,其中10例先證者具有氨基糖苷類用藥史。對照組男女比例為0.9:1(181:195),平均采集年齡25±4.12歲。
2、病例組篩查到706個線粒
3、體突變位點,其中D-loop區(qū)180個,12S rRNA基因27個(1個新位點和26個已報道位點),16S rRNA基因29個(7個新位點和22個已報道位點),tRNA基因29個(3個新位點和26個已報道位點),蛋白編碼區(qū)434個,包含122個錯義突變(4個新位點和108個已報道位點)和312個同義突變(20個新位點和292個已報道位點),非編碼區(qū)7個。
3、在病例組中,單體型D,G,M7,M8,M10,M11,M12,A,B
4、4,F(xiàn),H,N和R的頻率分別為24.74%,7.22%,5.15%,10.31%,1.03%,1.03%,1.03%,8.25%,5.15%,13.40%,7.22%,7.22%和8.25%,而在對照組中,它們的頻率分別為21.54%,4.26%,6.91%,10.64%,1.33%,0.53%,0.00%,6.65%,18.62%,15.96%,0.80%,8.78%和2.39%。其中單體型B、H、T在病例組和對照組之間的頻數(shù)差異具有
5、統(tǒng)計學(xué)意義。
結(jié)論:通過本研究發(fā)現(xiàn)了五個與耳聾相關(guān)的線粒體候選基因。
1、12S rRNA基因上新突變位點1473C>T,可能改變了12S rRNA的三級或四級結(jié)構(gòu),影響線粒體蛋白質(zhì)的合成,從而影響線粒體的功能。
2、tRNA基因上新突變位點614A>C位于tRNAPhe反密碼子環(huán)上(A37),突變可能影響密碼子識別的精確性,從而影響tRNA結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定性;新突變位點8339A>G位于tRNALys的T
6、臂上(A50),突變破壞了原有的A-U配對,tRNA結(jié)構(gòu)和功能穩(wěn)定性受到影響。
3、5656A>G位于輕鏈tRNAAla和輕鏈tRNAAsn之間,突變可影響tRNAAla和tRNAAsn前體的處理,易導(dǎo)致臨床表型異常。
4、線粒體ND13866T>C使NADH脫氫酶亞單位1上的極性疏水性異亮氨酸向蘇氨酸過渡,影響NADH脫氫酶活性和破壞線粒體的正常功能,進而造成內(nèi)耳的毛細胞損傷。
5、單體型H、T在病組和對
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