版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、目的:口腔扁平苔蘚是一種常見(jiàn)的非感染性口腔黏膜疾病,不易治愈,有一定的癌變傾向。該病好發(fā)于中年人,多見(jiàn)于40歲以上婦女,隨年齡增長(zhǎng)癥狀加重。該病病因不明,發(fā)病機(jī)制錯(cuò)綜復(fù)雜。近年來(lái),口腔扁平苔蘚的癌變病例報(bào)道呈上升趨勢(shì),因此,對(duì)口腔扁平苔蘚發(fā)病機(jī)制的研究成為口腔醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)?;蛐酒夹g(shù)是目前國(guó)際上興起不久且發(fā)展迅速的一項(xiàng)生物技術(shù),它在生命科學(xué)領(lǐng)域扮演著越來(lái)越重要的角色。基因芯片技術(shù)是目前基因研究方面最先進(jìn)、最有效的方法之一,隨著生物學(xué)
2、技術(shù)的發(fā)展,基因芯片技術(shù)越來(lái)越廣泛應(yīng)用于疾病發(fā)病機(jī)制的研究,從而發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因。本實(shí)驗(yàn)應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選口腔扁平苔蘚與正常口腔黏膜組織差異表達(dá)基因及其信號(hào)傳導(dǎo)通路,分析口腔扁平苔蘚發(fā)病相關(guān)的差異表達(dá)基因和信號(hào)傳導(dǎo)通路,進(jìn)而對(duì)口腔扁平苔蘚的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行深入研究。
方法:
1樣本采集
所有病變組織均來(lái)源于2008年5月至11月河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院口腔科臨床診斷為口腔扁平苔癬的患者,并經(jīng)知情同意取
3、病理時(shí)切取少量病變黏膜(組織病理診斷為口腔扁平苔蘚的繼續(xù)保留)。標(biāo)本于切除后10 min內(nèi)裝入經(jīng)無(wú)菌DEPC處理的凍存管中,然后儲(chǔ)存于液氮罐中轉(zhuǎn)運(yùn)到低溫冰箱中保存。對(duì)照正常組織來(lái)源于河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院口腔科無(wú)菌條件下健康者拔智齒時(shí)切除的齦黏膜或口腔整復(fù)術(shù)中切除的口腔黏膜,保存方法同OLP組織標(biāo)本。
2芯片的制作
由上??党杉夹g(shù)有限公司提供的含有32050個(gè)基因的高密度基因組芯片(phalanx臺(tái)灣)。取適量
4、(50~100 mg)正確保存的OLP組織樣本和正常組織,分別使用BioPulverize冰凍粉碎組織,加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。使用Nanodrop測(cè)定RNA在分光光度計(jì)230 nm、260 nm和280 nm的吸收值,以計(jì)算濃度并評(píng)估純度。用甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)RNA純度及完整性。取得RNAOC報(bào)告。經(jīng)檢測(cè)的RNA樣本
5、是高質(zhì)量的,完整的,沒(méi)有Rnase污染,沒(méi)有DNA污染,繼續(xù)實(shí)驗(yàn)。樣本RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA,cDNA第二鏈合成,aRNA合成及純化,熒光標(biāo)記aRNA并純化。使用Nanodrop檢測(cè)熒光標(biāo)記效率,標(biāo)記效率合格以保證后續(xù)芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。使用Ambion的RNA FragmentationReagents對(duì)標(biāo)記好的aRNA進(jìn)行片段化處理。在標(biāo)準(zhǔn)條件下將標(biāo)記好的探針和高密度基因組芯片進(jìn)行雜交。
3芯片掃描和圖像分
6、析
使用GenePix4000B芯片掃描儀掃描芯片的熒光強(qiáng)度,并將實(shí)驗(yàn)結(jié)果轉(zhuǎn)換成數(shù)字型數(shù)據(jù)保存,使用配套軟件(Genepix Pro V6.0和Genesring)對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析運(yùn)算,采用FoldChang和T-test方法篩選的兩組樣本間的差異表達(dá)基因和通路,以表達(dá)差異2倍為陽(yáng)性,為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
4 RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果的可靠性
本實(shí)驗(yàn)為了排除實(shí)驗(yàn)結(jié)果中篩選差異基因的錯(cuò)誤和假陽(yáng)性,對(duì)實(shí)驗(yàn)
7、結(jié)果部分標(biāo)本的部分基因采用RT-PCR驗(yàn)證。實(shí)驗(yàn)隨機(jī)選取7例標(biāo)本(3例正常和4例OLP)并隨機(jī)選取3個(gè)表達(dá)上調(diào)的基因(PHF19、DBH、CD72)進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證,為校正此差異,將RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。PCR擴(kuò)增。引物序列為:GAPDH:反義5'GGGAAACTGTGGCGTGAT3',正義:5'GAGTGGGTGTCGCTGTTGA3',片段長(zhǎng)度為299 bp。PHF19::反義F:5'CGGGAAGATCAAGAGGGTC
8、A3',正義:R:5'ATGCAGCGTCGGCAGAAC3',片段長(zhǎng)度為276bp。DBH:反義F:5'TGGTGATAGAAGGACGAAACG3',正義:R:5'GCAGTAGCCAGTGAGGATGAA3',片段長(zhǎng)度為158bp。CD72:反義F:5'CCAAATGGTGGTTCAGGGA3',正義:R:5'GGCACAGGTTCTTGTTGGC3',片段長(zhǎng)度為265bp。PCR反應(yīng)條件:95℃變性3min,40個(gè)PCR循環(huán)(9
9、4℃,20s;59℃,20s;72℃,30s);72℃延伸5 min。PCR反應(yīng)同時(shí)擴(kuò)增GAPDH作為內(nèi)參照,復(fù)性溫度及循環(huán)次數(shù)根據(jù)不同引物及模板進(jìn)行調(diào)整PCR產(chǎn)物與100 bp DNALadder在2%瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠染色,檢測(cè)PCR產(chǎn)物是否為單一特異性擴(kuò)增條帶并進(jìn)行灰度掃描成像。RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果由Rotor-GeneReal-Time Analysis Software6.0(Build14)軟件處理。
5
10、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
應(yīng)用Spss13.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)各組間比較利用單樣本均數(shù)比較T檢驗(yàn)分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
結(jié)果:
1經(jīng)過(guò)雜交篩選并與正常組織比較,從32050個(gè)基因中篩選出有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異表達(dá)基因142個(gè),其中上調(diào)表達(dá)基因25個(gè),下調(diào)表達(dá)基因117個(gè)。這些差異基因從分子生物學(xué)角度來(lái)說(shuō)大部分是細(xì)胞突變、生理性改變免疫應(yīng)答、增殖等。從細(xì)胞組成角度來(lái)講大多是細(xì)胞器、
11、細(xì)胞外基質(zhì)、蛋白質(zhì)的合成等。從分子功能角度講大多是黏附、催化活性、信號(hào)傳導(dǎo)功能、酶的活性等。
2有差異表達(dá)的通路8個(gè),為感染類疾病相關(guān)通路,氨基酸、蛋白質(zhì)、碳水化合物的合成和代謝類、聚糖的生物合成和代謝類及外源性化學(xué)物質(zhì)的合成和代謝類,與OLP密切相關(guān)通路是與參與感染類疾病的幽門螺桿菌感染上皮細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)通路(Epithelial cell signaling in Helicobacter pyloriinfection
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 口腔扁平苔蘚發(fā)病及其惡變機(jī)理的探討.pdf
- 口腔扁平苔蘚
- T淋巴細(xì)胞在口腔扁平苔蘚發(fā)病中作用的探討.pdf
- 口腔扁平苔蘚的回顧性研究.pdf
- 口腔扁平苔蘚治療的系統(tǒng)評(píng)價(jià).pdf
- OPN及其相關(guān)因子在口腔扁平苔蘚發(fā)病機(jī)制及其進(jìn)展中的作用.pdf
- 免疫反應(yīng)和細(xì)胞凋亡在口腔扁平苔蘚發(fā)病中的作用.pdf
- 扁平苔蘚
- 朗格罕細(xì)胞在口腔扁平苔蘚發(fā)病中的作用和意義.pdf
- 口腔扁平苔蘚的中醫(yī)證型分布研究.pdf
- 胸腺基質(zhì)淋巴細(xì)胞生成素在口腔扁平苔蘚發(fā)病中的免疫機(jī)制研究.pdf
- 口腔扁平苔蘚103例回顧性分析.pdf
- 苔蘚方治療糜爛型口腔扁平苔蘚的臨床療效觀察.pdf
- 口腔扁平苔蘚患者心血管疾病風(fēng)險(xiǎn)研究.pdf
- 細(xì)胞免疫和細(xì)胞凋亡在口腔扁平苔蘚發(fā)病中的作用與意義.pdf
- 口腔扁平苔蘚動(dòng)物模型的建立及口腔扁平苔蘚患者唾液酶、IL-18的檢測(cè)及臨床意義.pdf
- 口腔扁平苔蘚患者唾液中差異蛋白的檢測(cè)及ABCG2在口腔扁平苔蘚癌變過(guò)程中的表達(dá)研究.pdf
- 口腔扁平苔蘚患者唾液IL-17的檢測(cè).pdf
- 治療60例胃相關(guān)性口腔扁平苔蘚的臨床經(jīng)驗(yàn)探討
- 細(xì)胞角蛋白在口腔扁平苔蘚中表達(dá)的電泳研究.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論