13759.果蠅組織特異性的定量蛋白質組學研究

1、UDC：577中文圖書分類號：Q5學校代碼：10005學號：$201015067密級：公開北京工業(yè)大學碩士專業(yè)學位論文(全日制)題目：果蠅組織特異性的定量蛋白質組學研究英文題目：QUANTITATIVEPROTEOMICSSTUDYOFTISSUESPECIFICITYINDR0＆DP月刃■^經(jīng)￡Z4NOGASTER論文作者：學科專業(yè)：研究方向：申請學位：指導教師：所在單位：答辯日期：授予學位單位：邢曉華生物醫(yī)學工程化學生物學與分子醫(yī)學

2、工程碩士專業(yè)學位楊曉明研究員徐平研究員生命科學與生物工程學院2013年6月北京工業(yè)大學摘要摘要黑腹果蠅是生命科學領域常用的經(jīng)典模式生物，特別是在遺傳與發(fā)育生物學方面的研究已非常深入。長期的系統(tǒng)研究也使果蠅的基因組成為至今注釋最好的基因組之一，加之數(shù)以千計的果蠅疾病模型，為探索生命的奧秘和闡述疾病的機制奠定了堅實的基礎。但由于技術的限制，至今為止果蠅蛋白質組學研究，特別是大規(guī)模蛋白質組學研究的報道尚不多見。利用聚丙烯酰胺凝膠電泳與液相色譜

3、串聯(lián)質譜相結合的方法(GeLCMS／MS)測定果蠅成蟲的蛋白質組具有重要意義。為了降低樣品復雜性和提高蛋白鑒定率，在樣品多樣性和技術路線多樣性方面進行了改進和創(chuàng)新，通過選用普通SDSPAGE和對小分子量蛋白質有分離優(yōu)勢的TricineSDS—PAGE兩種凝膠對果蠅的軀干和頭部的蛋白質組分別進行了檢測。通過嚴格的質控標準，最終共鑒定得到5617個蛋白，對應到5262個基因，占目前報道果蠅基因總數(shù)的3823％。在實驗過程中我們發(fā)現(xiàn)，編碼果蠅

4、頭部的蛋白，其分子量分布都較為均一，與其他物種表現(xiàn)一致，而編碼果蠅軀干的大部分蛋白質，其分子量則較小，基本分布在分子量小于60kD的范圍內，這一現(xiàn)象目前在果蠅或其他物種的蛋白質組研究中還鮮有報道?；谶@種特殊的蛋白質分子量分布現(xiàn)象，我們通過無標定量的方法對軀干和頭部對應蛋白質的分子量進行了定量比較，并以定性和定量結果重構了電子膠圖。從擬合的結果看，果蠅軀干的蛋白在小分子量部分較為集中，而頭部蛋白的分子量大小分布則較為均勻，與實驗結果一致

5、。并且通過GO分析和Pathway富集的分析，發(fā)現(xiàn)軀干中表達上調的蛋白主要與消化系統(tǒng)、細胞代謝、能量代謝等基本生理功能相關，而頭部中表達上調的蛋自主要與神經(jīng)系統(tǒng)的功能相關，這與果蠅的軀干部行使基本功能，而頭部進行高級活動的本質相一致。之后采用iTRAQ的定量比較蛋白質組學技術對果蠅軀干和頭部的蛋白質組表達差異進行了進一步的分析，在保證定量結果準確性的基礎上，找到了大量的差異蛋白，并獲得與無標定量一致的結論。這為比較果蠅蛋白質組組織特異性