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文檔簡介
1、目的:利用同位素標記相對和絕對定量(iTRAQ)技術結合2維液相色譜-串聯(lián)質譜(2D-LC-MS/MS)技術篩選狼瘡腎炎(Lupus Nephritis,LN)和系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)非腎炎患者患者血清差異表達蛋白。為LN的早期診斷以及病情監(jiān)控,從血清定量蛋白質組學的方向提供新的角度和思路。
方法:采用LN患者和SLE非腎炎患者血清標本作為研究對象,并以健康人群血清為對照。利用安捷倫多重親和排除系統(tǒng)(MARS)分別去除各組血
2、清中的14種高豐度蛋白,并對低豐度蛋白進行超濾濃縮,分別標記為:①系統(tǒng)性紅斑狼瘡腎炎組(LN-low);②SLE非腎炎組(SLE-low);③健康對照組(N-low)。運用iTRAQ技術構建SLE非腎炎患者和LN患者在疾病不同階段的差異蛋白表達譜,并將所有的差異表達蛋白進行Gene Ontology(簡稱GO)分類和信號通路分析(IPA);隨后用免疫印跡法(WB)對差異蛋白--載脂蛋白B(APOB)、補體C1q子組件單元C(C,C1QC
3、)和血清淀粉樣蛋白A1(SAA1)進行蛋白水平的鑒定;最后使用SAA1(Human)ELISA Kit測定SAA1在LN、SLE非腎炎組和健康對照組血清樣本中的濃度,并用SPSS進行統(tǒng)計學分析。
結果:⑴用SDS-PAGE電泳來驗證待測血清高豐度蛋白的去除效率,結果顯示:可見的蛋白條增多,一些原本未見的低豐度蛋白條帶顯現(xiàn)出來;使用Quantity One軟件來做進一步的分析比較,98%以上的高豐度蛋白已被去除。⑵經iTRAQ聯(lián)
4、合2D-LC-MS/MS分析,共鑒定出302個非冗余蛋白(95%的可信區(qū)間)。通過設置差異蛋白的篩選標準:Cut-off值為ProtScore(unused)>1.5,且P<0.05,Ratio>1.2(上調)或Ratio<0.8(下調)。得到243個差異蛋白,其中LN組與健康對照組比較,有235個差異蛋白(上調蛋白233個,下調蛋白2個);SLE非腎炎組與健康對照組比較,有243個差異蛋白(上調蛋白3個,下調蛋白240個);LN組與S
5、LE非腎炎組比較,有243個差異蛋白,且全部是上調蛋白。⑶生物信息分析可知,差異蛋白主要位于細胞外,發(fā)揮炎癥反應或者急性反應的生物學作用;在IPA分析上差異蛋白的信號途徑主要有LXR/RXR激活、FXR/RXR激活以及補體系統(tǒng)等。用受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC曲線)分析血清SAA1在SLE非腎炎和LN的表達情況,其曲線下面積(area under the RO
6、C curve,記為AUC)診斷LN為0.843,P=0.001,當SAA1的Cut-off值為1.555μg/mL時,靈敏度為70.5%,特異度為85.7%。
結論:①經iTRAQ結合2D-LC-MS/MS技術分析,LN和SLE非腎炎之間存在243個的差異表達蛋白,且差異蛋白SAA1可能是診斷LN的潛在分子標志物。②SLE與LN的發(fā)生發(fā)展涉及機體多條作用通路,如免疫異常、機體急性反應以及血脂異常等。炎性反應可能是促進SLE與
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