雞卵細(xì)胞卵黃生成受體(OVR)基因的SNP-,s-研究.pdf

1、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文雞卵細(xì)胞卵黃生成受體(OVR)基因的SNP研究姓名：沈世學(xué)申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：動物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師：龔炎長2002.5.1S t u d i e s o l l t h e S N P o f t h e C h i c k e n ’sO V R G e n eA b S t r a c tT h eg e n e o fC h i c k ’so c c y t ev i t e l l o g e

2、 n e s i sr e c e p t o r ( O V R ) h a sa v e r yc l o s er e l a t i o n s h i pw i t h t h e i rp e r f o r m a n c e o fe g gp r o d u c t i o n ．T h eo b j e c t i v eo ft h i s r e s e a r c hi st os e a r c hS i n

3、 g l eN u c l e o t i d eP o l y m o r p h i s m s ( S N P s ) i n O V R g e n e ．F o u rt y p e so fc h i c k s ，4 8S i l k i e s ，5 2H y l i n eB r o w n ，5 0W h i t e L e g h o r na n d5 0 A b o r A c r e s b r o i l

4、e r s ，w e r e s t u d i e d i n t h i s r e s e a r c h ．T h eg e n o m i c D N A i se x t r a c t e db yt h et r a d i t i o n a lm e t h o do f p h e n o l i n t h r e et y p i e s ，a n db ys a l t o u ti nW h i t eL

5、e g h o r n ．B a s e d o nt h ec o n s e r v a t i v e s e q u e n c e i n t h ec D N A o f O V Rg e n e ，s i xp a i r s o f p r i m e r s w e r ed e s i g n e da n d u s e dt oa m p l i f y t h e f o u ri n t r o n s (

6、2 ，7 ，8 ，9 ) ．T h r e e n e w s e q u e n c e s o f i n t r o n s ( 2 ，7 ，9 ) w h i c h e x h i b i t e d p 0 1 y m o r p h i s m s w e r eo b t a i n e d b y s e q u e n c i n ga n dh a da l r e a d yb e e ns u b m i t

7、t e dt o G e n B a n k ．T h e s et h r e e i n t r o n sw e r e s t u d i e db y P C R —S S C P ，P C R —R F —S S C P a n ds e q u e n c i n g ，F(xiàn) i v eS N P s w e r ef o u n d a m o n gt h e m ．O n eS N P ( T —G ) w a sf

8、o u n da tt h e 1 2 2 “b po f 1 “f r a g m e n to f i n t r o n 2 ( 卜2 2 1 b p ) ：t w oS N P s ( C - Ta n dG - A ) ，a t t h e8 0 “b p a n d4 1 0 “b po f i n t r o n7r e s p e c t i v e l y ：a n dt w oS N P s ( T - Ca n d

9、T - A ) ，a tt h e9 1 8 ‘b p a n d3 3 6 ”b p o f i n t r o n 9r e s p e c t i v e l y ．A n a l y s i so f t h ef l a n k i n gs e q u e n c e so f t h e s eS N P s f o u n d t h a t o n er e s t r i c t i o n e n d o n u

10、c l e a s e e n z y m es i t e w a sc h a n g e d i n t h ep o l y m o r p h i cs i t ew i t h i nt h e1 “f r a g m e n to fi n t r o n2 、a n daP C R —R F L P w a sd e s i g n e dt og e n o t y p et h i ss i t e ．I ti ss

11、 h o w e dt h a tt h er e s u l to ft h e P C R —R F L Pi sc o m p l e t e l yc o i n c i d e n t w i t h t h a t o f t h eP C R - S S C P ．T h e g e n o t y p ef r e q u e n c i e s a n d t h e g e n ef r e q u e n c i

12、e s w e r ec a l c u l a t e da m o n gt h e s ef o u r s t o c k s a n ds i g n i f i c a n td i f f e r e n c e s i n g e n ef r e q u e n c i e sw e r e f o u n db e t w e e nt h e s e s t o c k s ．A f t e r a s s o c

13、 i a t i o n a n a l y s i s ，t h e n e w m o l e c u l a r m a r k e r sf o u n di n t h e c h i c kO V Rg e n e c o u l db e u s e d t o i m p r o v et h ep e r f o r m a n c e s o f e g g p r o d u c t i o nt h r o u