牦牛GH基因多態(tài)性的PCR-SSCP分析.pdf

1、以甘南牦牛、天祝白牦牛和青海高原牦牛3個(gè)群體為研究對(duì)象，采用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)牦牛生長(zhǎng)激素（GH）基因5個(gè)外顯子及部分內(nèi)含子序列進(jìn)行遺傳變異分析，旨在獲取相應(yīng)的分子遺傳學(xué)信息，明確牦牛GH基因的遺傳特性，為牦牛重要性狀的分子標(biāo)記和改良提供依據(jù)。研究結(jié)果如下：3個(gè)牦牛群體GH基因的GH-P1、GH-P2和GH-P4的擴(kuò)增產(chǎn)物通過PCR-SSCP檢測(cè)分析，均未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性。GH-P3擴(kuò)增片段在第3內(nèi)含子1694bp處發(fā)生T→C轉(zhuǎn)化，形成A

2、、B兩個(gè)等位基因，檢測(cè)到AA、AB、BB3種基因型。等位基因A（B）在甘南牦牛、天祝白牦牛和青海高原牦牛的基因頻率分別為：0.8342（0.1658）、0.9028（0.0972）和0.8958（0.1042），等位基因A為三個(gè)群體中的優(yōu)勢(shì)等位基因。GH-P5擴(kuò)增片段有C、D兩個(gè)等位基因，檢測(cè)到CC和CD2種基因型。其中，甘南牦牛GH基因第5外顯子2154bp處發(fā)現(xiàn)A→G單堿基突變，導(dǎo)致由甘氨酸（Gly）變?yōu)榻z氨酸（Ser）；天祝白牦牛

3、第5外顯子2373bp處發(fā)現(xiàn)G→T單堿基突變，但未引起氨基酸變化，為沉默突變；青海高原牦牛在此位點(diǎn)未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性。等位基因C（D）在甘南牦牛、天祝白牦牛群體的基因頻率分別為：0.9158（0.0842）、0.916（0.084）。等位基因C為群體中的優(yōu)勢(shì)等位基因。通過多態(tài)信息含量（PIC）統(tǒng)計(jì)，GH-P3和GH-P5擴(kuò)增區(qū)域產(chǎn)生的SNPs位點(diǎn)均處于低度多態(tài)（PIC<0.25）。進(jìn)行了Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)，第3內(nèi)含子3個(gè)牦牛