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文檔簡介
1、鑒定已知蛋白的相互作用蛋白為探究其蛋白功能和分子機(jī)制提供重要依據(jù)。確定蛋白的相互作用的方法之一是免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,co-IP)后進(jìn)行質(zhì)譜(mass spectrometry,MS),這種方法可以確保從生理條件下的細(xì)胞或組織中分離、鑒定靶蛋白和其相互作用蛋白。
本文主要先通過Co-IP與LC-MS聯(lián)用檢測TRIM3的相互作用蛋白,后對檢測的結(jié)果分析、篩選,再通過分子生物學(xué)實驗進(jìn)一步驗證質(zhì)譜
2、檢測結(jié)果,且在宮頸癌和乳腺癌細(xì)胞中探究TRIM3的功能,與質(zhì)譜結(jié)果對照。本課題研究的主要工作是:
?。?)通過Co-IP、LC-MS/MS聯(lián)用檢測HeLa細(xì)胞中能與TRIM3相互作用的蛋白,對這些蛋白的定位、功能和作用進(jìn)行統(tǒng)計、分析,來更全面的探究在復(fù)雜的細(xì)胞內(nèi)環(huán)境中,TRIM3是如何發(fā)揮其功能的。本文檢測到了227個能與TRIM3相互作用的蛋白質(zhì),這些蛋白中有部分是p53信號通路的重要成員。
(2)通過質(zhì)譜篩選出p5
3、3信號通路后,進(jìn)行Western Blot、免疫印跡等實驗檢測TRIM3與重要抑癌蛋白p53間的作用,結(jié)果顯示TRIM3可以使p53蛋白水平下調(diào)。通過熒光素酶報告基因檢測TRIM3對p53靶蛋白p21啟動子活性的影響,結(jié)果顯示在缺失p53時TRIM3不能影響p21的轉(zhuǎn)錄,而p53存在時TRIM3通過下調(diào)p53來抑制p21的轉(zhuǎn)錄。
?。?)探究TRIM3在宮頸癌細(xì)胞系和乳腺癌細(xì)胞系中的作用。實驗方法如下:通過RT-PCR檢查TRI
4、M3在不同細(xì)胞系中mRNA水平的表達(dá)情況,結(jié)果顯示中T-47D中TRIM3表達(dá)較多,HeLa中TRIM3表達(dá)較少;通過MTT和克隆形成實驗檢測TRIM3對細(xì)胞增殖能力的影響,結(jié)果顯示TRIM3可以顯著抑制宮頸癌細(xì)胞系和乳腺癌細(xì)胞系的增殖,而這不依賴于p53;通過劃痕實驗檢測TRIM3對細(xì)胞遷移能力的影響,TRIM3不能影響細(xì)胞的遷移;通過流式細(xì)胞術(shù)檢測TRIM3對細(xì)胞周期的影響,在有p53存在時TRIM3才能影響細(xì)胞周期進(jìn)程。
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