人源天然免疫相關蛋白SPLUNC1的結構生物學研究.pdf

1、含BPI結構域超家族由一類能結合轉運脂分子的蛋白所組成，根據(jù)來源和大小不同，主要分為兩個亞家族:類BPI蛋白家族和類Takeout蛋白家族。PLUNC蛋白是最近發(fā)現(xiàn)的在哺乳動物呼吸系統(tǒng)特異分布的蛋白，根據(jù)基因定位和序列比對分析，可能含有一個或者兩個BPI結構域。人源SPLUNC1是PLUNC家族最重要的一個蛋白，含有一個BPI結構域，在天然免疫系統(tǒng)發(fā)揮了重要作用。SPLUNC1能夠結合LPS分子，具有殺菌作用，而且是表面活性劑蛋白。由于

2、SPLUNC1的溶解度很低，為了獲得SPLUNC1的晶體結構，我們將SPLUNC1融合于MBP標簽之后，獲得了可溶性的融合蛋白。經(jīng)過篩選優(yōu)化，我們獲得了分辨率為2.5(A)的融合蛋白的晶體。使用單波長反常散射，我們解析了硒代SPLUNC3A的晶體結構。
　　SPLUNC1含有一個BPI桶狀結構域，由α螺旋和一個β折疊片組成，在C末端還有一段螺旋α4堵在桶的一端。SPLUNC1在β2和β3之間存在一個非常保守的發(fā)夾結構，這個發(fā)夾結構

3、可以通過側鏈與C末端肽鏈之間形成氫鍵，將C末端錨定在α1和β2之間。在SPLUNC1的分子內(nèi)部存在兩個疏水腔，SPLUNC1應該使用靠近α4的疏水腔來結合LPS分子。SPLUNC3A截短了N末端24個殘基，無法結合LPS分子，也不具有抑菌功能。根據(jù)同源結構比對，我們推測SPLUNC1通過N末端構象變化打開輸水通道，暴露內(nèi)部疏水腔，用以結合LPS分子。在SPLUNC1的表面，電荷均勻分布，我們沒有找到大片的疏水區(qū)來解釋SPLUNC1的低溶