口蹄疫病毒Asia1-1-YZ-CHA-06的全基因組序列分析.pdf

1、口蹄疫(Foot-and-MouthDisease，F(xiàn)MD)是偶蹄動物的一種急性、熱性、高度接觸性傳染病，其病原口蹄疫病毒(Foot-and-MouthDiseasevirus，F(xiàn)MDV)屬于小RNA病毒科口蹄疫病毒屬的成員，為單股正鏈RNA，其基因組RNA全長約8.5kb，可直接作為mRNA，編碼并翻譯出一個多聚蛋白，然后經(jīng)過一系列裂解，產(chǎn)生4種結(jié)構(gòu)蛋白(VP1、VP2、VP3和VP4)和10種非結(jié)構(gòu)蛋白(L、2A、2B、2C、3A、

2、3B1、3B2、3B3、3C和3D)。根據(jù)動物交叉保護和血清學試驗，F(xiàn)MDV可分為O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和Asial型共7種血清型，不同血清型間不能交叉免疫保護，給口蹄疫的控制和消滅造成了極大的困難。目前FMD呈世界范圍的流行趨勢，但其血清型的分布具有一定的地理區(qū)域性。我國于1958年在云南保山縣首先發(fā)現(xiàn)Asial型FMD，且在之后30多年里該型FMDV的流行僅局限于Asial/YNBS/58譜系，但2005年以來我國

3、在江蘇、甘肅、北京、河南等地爆發(fā)了江蘇譜系A(chǔ)sial型FMD(Asial/JS/CHA/05)，該譜系毒株與Asial/YNBS/58株相比有較大的遺傳偏離，來源于印度1980年流行毒株(Asial/IND/1980)。該譜系毒株在我國牛群中一經(jīng)流行，趨勢迅猛，造成的損失極為嚴重，因此積極開展Asial型FMD江蘇譜系毒株的研究，對我國FMD的防控具有重要的意義。FMDV全基因組的測定和組裝，為FMDV致病性的研究、以及新型疫苗和診斷技

4、術(shù)的研制奠定了基礎(chǔ)。 本研究對分離到的江蘇譜系A(chǔ)sial型FMDV豬源毒株Asial/1/YZ/CHA/06進行了測序和全基因組序列分析。同時，根據(jù)本實驗室已測定的江蘇譜系A(chǔ)sial型FMDV牛源毒株Asial/YS/CHA/05全基因組序列的基礎(chǔ)，利用5’RACE方法從Asial/YS/CHA/05株細胞傳代毒中擴增得到5’末端的真實序列，采用常規(guī)RT-PCR技術(shù)擴增得到六段相互重疊基因組片段，分別克隆至pOK12低拷貝載體中