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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:篩選分析喉癌及對(duì)應(yīng)的癌旁組織的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(LncRNA)的表達(dá)差異性,探究差異表達(dá)的LncRNA的臨床意義,為尋找喉癌新型診斷指標(biāo)以及治療的改善提供新線索。
方法:利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)6對(duì)喉癌及相對(duì)應(yīng)的癌旁組織中LncRNA的差異表達(dá)情況,構(gòu)建Incrna的差異表達(dá)譜,利用生物信息學(xué)手段對(duì)差異表達(dá)的LncRNA進(jìn)行分析,篩選出具有顯著表達(dá)差異(Fc>2.0,P≤0.05)的LncRNA,再利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)
2、驗(yàn)證在38對(duì)喉癌以及相對(duì)應(yīng)的癌旁組織中驗(yàn)證芯片結(jié)果中部分具有顯著差異表達(dá)的LncRNA(NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1),以進(jìn)一步驗(yàn)證基因芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果,并將其表達(dá)與臨床病理特征相結(jié)合,尋找4個(gè)差異表達(dá)的LncRNA與臨床病理特征的關(guān)系。
結(jié)果:6對(duì)喉癌及相對(duì)應(yīng)癌旁組織相比,有4477個(gè)差異表達(dá)的LncRNA,其中有748個(gè)LncRNA
3、表達(dá)上調(diào)和3729個(gè)LncRNA表達(dá)下調(diào)。選擇4個(gè)差異表達(dá)的LncRNA: NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示在38對(duì)喉癌及相對(duì)應(yīng)癌旁組織中NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1具有差異表達(dá)(P值分別為0.0202、0.0384、
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