單核苷酸多態(tài)性與乳腺癌新輔助化療療效的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、目的：利用甘肅省腫瘤醫(yī)院乳腺科甘肅省乳腺病診治中心和甘肅省醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤組織和淋巴細(xì)胞庫(kù)資源，用TaqMan OpenArray基因分型系統(tǒng)聯(lián)合檢測(cè)與乳腺癌新輔助化療密切相關(guān)的基因及其SNPs。通過(guò)以下方面進(jìn)行深入研究：1.探討甘肅漢族婦女乳腺癌患者新輔助化療密切相關(guān)的基因的基因型分布。2.通過(guò)基因及其SNPs的研究，篩選新輔助化療方案療效和毒性相關(guān)的基因型分布。3.篩選與乳腺癌新輔助化療方案療效及預(yù)后相關(guān)的遺傳標(biāo)志物。
　　方法

2、：依據(jù)不同的新輔助化療方案遴選符合入組條件的乳腺癌病例，化療前采集患者外周靜脈血2 mL，利用北京百泰克公司DNA提取試劑盒提取基因組DNA；提取的DNA，采用ND2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度，要求所有DNA樣本濃度為20~80 ng/μL，OD值在1.7~2.0之間；分裝于1.5 mL Eppendorf（EP）管中，-80℃冰箱保存?zhèn)溆茫挥妹绹?guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)（Applied Biosystems，AB）的TaqMan技術(shù)，采用T

3、aqMan OpenArray基因分型系統(tǒng)實(shí)施SNPs分析；所有患者按照RECIST標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)療效；隨機(jī)選取5％的DNA樣本送金維智公司進(jìn)行PCR測(cè)序分析，以驗(yàn)證Taqman Openarray基因分型結(jié)果的可靠性；采用χ2檢驗(yàn)比較各基因型化療效果差異及療效關(guān)系，分析基因型分布頻率。
　　1.MDR1 rs1045642各基因型頻率分別為AA（18.1%），AG（41.8%），GG（40.1%）；MDR1 rs1128503各基因型

4、頻率分別為AA（38.1%），AG（46.9%），GG（15.0%）；CD44 rs187115各基因型頻率分別為CC（8.6%），CT（29.8%），TT（61.6%）。
　　2.186例乳腺癌新輔助化療患者中，化療受益（CR+PR）為82例，總有效率為44.1%；TNM分期中，II期患者比例為44.6%，III期患者比例為53.2%，IV患者比例為2.2%?？ǚ綑z驗(yàn)顯示，患者年齡、TNM分期與化療療效均無(wú)明顯相關(guān)性（p>0.0

5、5）。
　　3.在MDR1基因型rs1045642位點(diǎn)中，野生型（AA）、雜合型（AG）、突變型（GG）的受益率分別占總受益率的10.7%、17.5%、16.4%；AG型與AA型比較，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.098），GG型與AA型比較，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.081）。在MDR1基因型rs1128503位點(diǎn)中，野生型（AA）、雜合型（AG）、突變型（GG）的受益率分別占總受益率的21.1%，17.1%，5.4%；AG型與AA

6、型比較，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.032），提示AA型的化療效果優(yōu)于AG型，GG型與AA型比較，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.131）。在CD44基因型rs187115位點(diǎn)中，野生型（CC）、雜合型（CT）、突變型（TT）的受益率分別占總受益率的4.0%，11.9%，28.5%；CT型與CC型比較，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.692），TT型與CC型比較，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.996）。
　　4. MDR1 rs1045642 GG

7、基因型與中性粒細(xì)胞減少癥相關(guān)， III-IV度的發(fā)生率為2.8%（2/71），明顯低于AA（9.4%）和AG型（20.3%），χ2=7.188，p=0.027。未發(fā)現(xiàn)MDR1 rs1045642多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。MDR1 rs1128503 GG基因型與中性粒細(xì)胞減少癥相關(guān)， III-IV度的發(fā)生率為4.5%（1/22），明顯低于AA（10.8%）和AG型（27.5%），χ2=9.077，p=0.0

8、11。未發(fā)現(xiàn)MDR1 rs1128503多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。CD44 rs187115 TT基因型與白細(xì)胞減少癥相關(guān)，III-IV度的發(fā)生率為2.2%（2/93），明顯低于CC（23.1%）和CT型（6.7%），χ2=10.194，p=0.006。未發(fā)現(xiàn)CD44 rs187115多態(tài)性與血紅蛋白減少、中性粒細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。
　　結(jié)論：基因芯片檢測(cè)方法簡(jiǎn)單快速且高通量，適用于大規(guī)模