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文檔簡介
1、目的:探討TSPAN8基因rs1051334、rs2270587位點單核苷酸多態(tài)性與廣西扶綏縣肝癌高發(fā)區(qū)肝癌家系遺傳易感性的關(guān)系。
方法:采用病例-對照研究方法,收集廣西扶綏縣肝癌高發(fā)地區(qū)20個肝癌高發(fā)家系(共79例,其中肝癌患者20例及直系親屬59例)及10個正常對照家系(共40例)作為研究對象,運用飛行時間質(zhì)譜分析技術(shù)(MALDI-TOF)檢測TSPAN8基因rs1051334、rs2270587位點基因型。運用SPSS1
2、7.0軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。所有統(tǒng)計學(xué)分析結(jié)果采用雙側(cè)概率檢驗,以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。根據(jù)Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢測各組人群基因型吻合度。使用x2檢驗計算各組人群等位基因型分布差異。并應(yīng)用非條件Logistic回歸模型分析該基因候選位點基因型多態(tài)性與肝癌家系遺傳易感性的關(guān)系。
結(jié)果:
1.(1)肝癌高發(fā)家系組人群TSPAN8基因rs1051334位點攜帶TT、TG、GG3種基因型,其
3、分布頻率分別是55.7%、34.2%、10.1%;對照家系組人群TSPAN8基因rs1051334位點攜帶TT、TG、GG3種基因型,其分布頻率分別是62.2%、35.1%、2.7%。兩組各基因型實際值與期望值吻合度好。
(2)肝癌高發(fā)家系組人群TSPAN8基因rs2270587位點攜帶CC、CT、TT3種基因型,其分布頻率分別是67.1%、31.6%、1.3%;對照家系組人群TSPAN8基因rs2270587位點攜帶CC、C
4、T、TT3種基因型,其頻率分別是50.0%、45.0%、5.0%。兩組各基因型實際值與期望值吻合度好。
2.(1)肝癌高發(fā)家系患者組、肝癌高發(fā)家系非患者組及正常對照家系組人群TSPAN8基因rs1051334位點T等位基因頻率分別為72.5%、72.9%和79.7%,G等位基因頻率分別為27.5%、27.1%、20.3%。肝癌高發(fā)家系患者組與非患者組等位基因頻率分布無顯著差異,肝癌高發(fā)家系患者組與正常對照家系組等位基因頻率分布
5、無顯著差異。在肝癌高發(fā)家系非患者組人群中,攜帶GT基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶TT基因型個體的1.15倍(95%CI為0.32~4.13);攜帶GG基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶TT基因型個體的0.62倍(95%CI為0.08~4.87)。在正常對照家系組人群中,攜帶GT基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶TT基因型個體的2.82倍,攜帶GG基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶TT基因型個體的3.61倍(95%CI為0.21~63
6、.44),但差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。
(2)肝癌高發(fā)家系患者組、非患者組及正常對照家系組人群TSPAN8基因rs2270587位點C等位基因頻率分別為90.0%、80.5%和72.5%,T等位基因頻率分別為10.0%、19.5%、27.5%。肝癌高發(fā)家系患者組與非患者組等位基因頻率分布無顯著差異,肝癌高發(fā)家系患者組與正常對照家系組等位基因頻率分布有顯著差異,正常對照家系組人群攜帶T等位基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶C等位基因型
7、個體的0.29倍(95%CI為0.09~0.92)。在肝癌家系非患者組人群中,攜帶CT基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶CC基因型個體的0.42倍(95%CI為0.11~1.66),但未見顯著差異,攜帶TT基因型的個體發(fā)生肝癌的風(fēng)險無法計算出來。在正常對照家系組人群中,攜帶CT基因型的個體發(fā)生HCC的風(fēng)險是攜帶CC基因型個體的0.34倍(95%CI為0.07~1.59),但未見顯著差異,攜帶TT基因型的個體發(fā)生肝癌的風(fēng)險無法計算。
8、> 結(jié)論:
1.在廣西扶綏縣人群中,TSPAN8基因rs1051334位點、rs2270587位點各基因型分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律;
2.TSPAN8基因rs1051334位點單核苷酸多態(tài)性與廣西扶綏縣人群肝癌家系的遺傳易感性無明顯相關(guān)性;
3.TSPAN8基因rs2270587位點單核苷酸多態(tài)性與廣西扶綏縣人群肝癌家系的遺傳易感性有相關(guān)性,rs2270587位點T等位基因為廣西扶
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