缺氧誘導(dǎo)因子-1α與冠狀動(dòng)脈缺血性心肌病的關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、目的：
　　1、利用生物信息學(xué)工具對(duì)缺血性心肌病的基因芯片進(jìn)行分析，為后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究篩選出有意義的基因；2、探討在排除混雜因素和效應(yīng)修飾因子后，缺氧誘導(dǎo)因子-1α的表達(dá)對(duì)缺血性心肌病發(fā)病的獨(dú)立作用大小，從而為缺血性心肌病的病因?qū)W研究和法醫(yī)病理學(xué)鑒定提供新思路。
　　方法：
　　1.在美國(guó)國(guó)立生物信息中心（NCBI）公共基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO）中下載缺血性心肌病的相關(guān)基因芯片數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)版處理后，采用Limma（R語(yǔ)

2、言軟件包）統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)計(jì)算缺血性心肌病組ICM與正常樣本組NF的顯著性P值，采用Benjamini&Hochberg方法進(jìn)行多重檢驗(yàn)糾正計(jì)算FDR，根據(jù)FDR值小于等于0.05來(lái)篩選差異基因。對(duì)差異化基因最近鄰基因進(jìn)行GO功能富集分析及KEGG Pathway功能富集分析，最后利用STRING構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)；2.收集貴州醫(yī)科大學(xué)法醫(yī)司法鑒定中心于2013-2015年尸檢病例，納入標(biāo)準(zhǔn)為：病理學(xué)診斷證實(shí)有不同程度冠狀動(dòng)脈狹窄，

3、或生前已確診為罹患冠心病者；排除標(biāo)準(zhǔn)：合并其他類(lèi)型心肌??；死亡至尸檢時(shí)間>72小時(shí)。3.以是否發(fā)生缺血性心肌病作為分組，通過(guò)獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)、曼惠特U檢驗(yàn)、卡方檢驗(yàn)等統(tǒng)計(jì)學(xué)方法，對(duì)相關(guān)臨床特征進(jìn)行描述分析。4.對(duì)符合納入標(biāo)準(zhǔn)的心肌組織進(jìn)行HE染色，光鏡觀察心肌病理變化；免疫組化染色觀察缺氧誘導(dǎo)因子-1α在心肌細(xì)胞核中的表達(dá)情況。5.建立多個(gè)回歸方程模型，對(duì)缺氧誘導(dǎo)因子-1α與缺血性心肌病的獨(dú)立效應(yīng)值大小進(jìn)行評(píng)估。
　　結(jié)果：

4、　　1.共找到差異基因1358個(gè)，參與細(xì)胞周期，縫隙鏈接、P53等生物過(guò)程及信號(hào)通路；將差異表達(dá)明顯的基因構(gòu)建的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)，發(fā)現(xiàn) HIF1α基因位于網(wǎng)絡(luò)的中心；2.在控制混雜因素和效應(yīng)修飾因子的條件下，HIF-1a對(duì)缺血性心肌病的獨(dú)立作用為：以HIF-1a表達(dá)陰性組作為參照，弱陽(yáng)性樣本發(fā)生缺血性心肌病的概率病未提高（P均>0.05）。而陽(yáng)性、強(qiáng)陽(yáng)性樣本與陰性樣本相比，ICM的發(fā)生率提高了3.7及7.5倍（模型1）；而模型2則分別提高4