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文檔簡介
1、目的:
1.基于高通量測序數(shù)據(jù)庫,篩選與細(xì)胞分化和軸突導(dǎo)向相關(guān)的microRNAs;
2.基于生物信息學(xué)方法和實(shí)驗(yàn)手段,明確miR-16,miR-30c與sema3A的靶向關(guān)系;
3.探討miR-30c/sema3A對體內(nèi)成年室下區(qū)新生神經(jīng)元的影響;
4.揭示miR-30c/sema3A影響成年室下區(qū)新生神經(jīng)元的機(jī)制;
5.檢測miR-30c對嗅球新生神經(jīng)元的影響;
6.探討m
2、iR-30c/sema3A在調(diào)控成年神經(jīng)再生信號通路上的下游介導(dǎo)分子和機(jī)制;
7.檢測miR-30c/sema3A引起的成年神經(jīng)再生能力的改變對嗅覺和記憶的影響。
方法:
1.利用基因表達(dá)文庫(Gene Expression Omnibus,GEO)高通量測序結(jié)果和系統(tǒng)聚類分析(Hierarchical Clustering,HCL)及自組織映射(Self-organization Mapping,SOM)
3、表達(dá)模式分析,篩選不同發(fā)育時期間的差異表達(dá)microRNAs;
2.構(gòu)建microRNAs上調(diào)和下調(diào)載體及雙熒光素酶報告系統(tǒng)檢測載體,合成microRNAs mimics等,通過雙熒光素酶報告系統(tǒng)及qRT-PCR檢測microRNAs和sema3A的表達(dá)量,確定microRNAs與sema3A基因之間的靶向關(guān)系;
3.構(gòu)建microRNA上調(diào)和下調(diào)慢病毒載體,進(jìn)行慢病毒包裝,通過腦立體注射技術(shù)分別將microRNA上
4、調(diào)和下調(diào)慢病毒注射到室管下區(qū)以檢測microRNA對成年室下區(qū)新生神經(jīng)元數(shù)量的影響,并通過流式分選(FACS)和qRT-PCR定量技術(shù),檢測microRNA和sema3A在此過程中對應(yīng)表達(dá)量的變化;
4.對成體室下區(qū)腦片和microRNA上調(diào)及下調(diào)處理的室下區(qū)原代神經(jīng)元的形態(tài)進(jìn)行分析,并利用實(shí)時細(xì)胞檢測系統(tǒng)(RTCA)和流式細(xì)胞儀分別對細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期進(jìn)行檢測;
5.利用BrdU對新生神經(jīng)元進(jìn)行追蹤;通過腦立體注射
5、技術(shù)將miR-30c上調(diào)和下調(diào)慢病毒分別注射到室管下區(qū),之后對腦片的干細(xì)胞及分化細(xì)胞進(jìn)行特異性免疫熒光顯色,以檢測miR-30c對室下區(qū)微區(qū)和嗅球內(nèi)不同種系神經(jīng)元的影響;利用TUNEL試劑盒對室下區(qū)凋亡情況進(jìn)行檢測;
6.設(shè)計GSK3β和c-myc siRNA,利用上述siRNA分別對神經(jīng)母瘤細(xì)胞Neuro2A進(jìn)行處理,隨后對細(xì)胞的形態(tài)和增殖(RTCA)情況進(jìn)行檢測,并利用蛋白免疫印跡對上述處理后的蛋白水平進(jìn)行檢測,以確定分子
6、之間的相互關(guān)系;
7.對miR-30c過表達(dá)和下調(diào)后所引起的嗅球整體結(jié)構(gòu)的變化進(jìn)行檢測,利用食物掩埋方法,檢測miR-30c表達(dá)水平變化后對嗅覺行為的影響;并利用腦立體注射技術(shù)、BrdU新生神經(jīng)元追蹤技術(shù)、條件恐懼記憶和水迷宮行為學(xué)實(shí)驗(yàn)檢測齒狀回內(nèi)miR-30c表達(dá)水平變化對海馬新生神經(jīng)元的影響及對海馬的條件記憶和空間記憶的影響。
結(jié)果:
1、篩選出能同時參與細(xì)胞增殖和軸突導(dǎo)向microRNAs
7、我們基于GEO數(shù)據(jù)庫,對不同發(fā)育時期室下區(qū)高通量ncRNA測序數(shù)據(jù)進(jìn)行提取,隨后對其進(jìn)行方差分析,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)microRNA占8%(74個),對這些microRNAs進(jìn)行聚類分析和SOM表達(dá)模式分析后,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)microRNAs的表達(dá)模式有兩種(逐漸增加型:63個microRNAs;逐漸下降型:11個microRNAs)。其中miR-16和miR-30c是差異表達(dá)最為顯著的2個microRNAs,均屬于表達(dá)模式降低型microRN
8、As。隨后的生物信息學(xué)分析顯示, sema3A可以通過同時參與兩信號通路的miR-16和miR-30c而與細(xì)胞分化途徑相聯(lián)系。
2、miR-30c是sema3A特異的調(diào)控因子
通過雙熒光素酶報告系統(tǒng),我們發(fā)現(xiàn)miR-30c能夠顯著抑制sema3A的表達(dá)(55±1.2%,p<0.05),當(dāng)sema3A與miR-30c結(jié)合位點(diǎn)突變后,發(fā)現(xiàn)miR-30c對sema3A的抑制性被解除(78±4%,p>0.05)。而無論在se
9、ma3A的野生型報告系統(tǒng)還是突變型報告系統(tǒng),miR-16對sema3A的表達(dá)均無影響。不同濃度的microRNAs mimics的雙熒光素酶報告系統(tǒng)檢測結(jié)果驗(yàn)證了上述結(jié)果的正確性。用上述載體和mimics處理Neuro2A細(xì)胞后,qRT-PCR檢測microRNAs和sema3A的表達(dá),發(fā)現(xiàn)miR-30的表達(dá)與sema3A呈負(fù)相關(guān),而miR-16的表達(dá)與sema3A之間則無相關(guān)性。并且,在Neuro2A細(xì)胞中,sema3A的表達(dá)與miR
10、-30c上調(diào)載體呈現(xiàn)負(fù)相關(guān);而與miR-30c下調(diào)載體的表達(dá)趨勢高度一致。上述結(jié)果證實(shí),miR-30c是sema3A的調(diào)控因子。
3、miR-30c通過負(fù)向調(diào)控sema3A的表達(dá)增加新生神經(jīng)元的數(shù)量
利用BrdU分別對腦立體注射有miR-30c上調(diào)和下調(diào)慢病毒的小鼠進(jìn)行新生神經(jīng)元追蹤,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-30c上調(diào)后可明顯促進(jìn)室下區(qū)及遷移流內(nèi)新生神經(jīng)元的數(shù)量(室下區(qū):4.59±1.74倍,p<0.01;遷移流:8.69±
11、1.32倍,p<0.001),miR-30c下調(diào)后的結(jié)果與此相反。利用流式細(xì)胞儀對室下區(qū)表達(dá)miR-30c上調(diào)和下調(diào)載體的細(xì)胞進(jìn)行分選,隨后的qRT-PCR結(jié)果顯示miR-30c上調(diào)細(xì)胞中,sema3A的表達(dá)明顯降低(0.41±0.012倍,p<0.001);miR-30c下調(diào)細(xì)胞中,sema3A的表達(dá)明顯增加(2.48±0.023倍,p<0.001)。此結(jié)果提示,miR-30c通過負(fù)向調(diào)控sema3A來影響室下區(qū)新生神經(jīng)元的數(shù)量。
12、r> 4、miR-30c/sema3A通過調(diào)控細(xì)胞增殖和分化途徑來影響新生神經(jīng)元數(shù)量
為了進(jìn)一步檢測miR-30c/sema3A是通過什么途徑來影響室下區(qū)新生神經(jīng)元的數(shù)量,我們利用miR-30c上調(diào)和下調(diào)慢病毒處理體外培養(yǎng)的室下區(qū)原代神經(jīng)元,對其細(xì)胞形態(tài)進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)miR-30c上調(diào)后,室下區(qū)神經(jīng)元分化程度明顯降低,miR-30c下調(diào)后,室下區(qū)神經(jīng)元分化程度得到加強(qiáng)。體內(nèi)miR-30c上調(diào)和下調(diào)慢病毒侵染室下區(qū)腦片的細(xì)胞形
13、態(tài)也印證了以上結(jié)果。隨后,利用實(shí)時細(xì)胞檢測技術(shù)(RTCA)分別對miR-30c上調(diào)和下調(diào)載體處理的Neuro2A的增殖進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn) miR-30c上調(diào)后細(xì)胞增殖明顯增強(qiáng),而miR-30c下調(diào)后細(xì)胞增殖明顯降低。進(jìn)一步的細(xì)胞周期檢測結(jié)果顯示,miR-30c上調(diào)后,可以明顯加速細(xì)胞周期的進(jìn)程。而miR-30c下調(diào)后,明顯抑制細(xì)胞周期的進(jìn)程。
5、GSK3β/c-myc介導(dǎo)了miR-30c/sema3A的細(xì)胞增殖和分化信號通路
14、r> 通過對相關(guān)文獻(xiàn)和信號通路的分析,我們鎖定GSK3β/c-myc分子作為備選的miR-30c/sema3A的下游信號介導(dǎo)分子。通過siRNA分別干擾GSK3β和c-myc,對細(xì)胞增殖和形態(tài)進(jìn)行分析,我們發(fā)現(xiàn)GSK3β具有促進(jìn)細(xì)胞分化抑制細(xì)胞增殖的功能,而c-myc的功能與此相反;聯(lián)合miR-30c上調(diào)和下調(diào)后細(xì)胞增殖和分化的結(jié)果,及對上述處理組相應(yīng)蛋白表達(dá)情況的鑒定,我們得出miR-30c上調(diào)后負(fù)向調(diào)控sema3A的表達(dá),sema
15、3A表達(dá)降低后,抑制GSK3β的活性,從而使c-myc Thr58位點(diǎn)磷酸化水平降低,c-myc總量增加,從而促進(jìn)細(xì)胞增殖;miR-30c下調(diào)后結(jié)果與此相反。
6、miR-30c引起的細(xì)胞增殖分化通路對嗅球和海馬結(jié)構(gòu)和功能的影響
miR-30c表達(dá)水平的變化可以改變細(xì)胞增殖和分化速度,引起新生神經(jīng)元數(shù)量的變化。為了檢測miR-30c對新生神經(jīng)元遷移靶區(qū)的影響,我們分別對室下區(qū)和海馬齒狀回進(jìn)行腦立體定位顯微注射miR-
16、30c上調(diào)和下調(diào)慢病毒。BrdU新生神經(jīng)元追蹤,干細(xì)胞和分化細(xì)胞特異性免疫熒光顯色結(jié)果顯示,miR-30c上調(diào)后,各處理組較之對照組在遷移速度上無差異。室下區(qū)、嗅球及海馬齒狀回處的新生神經(jīng)元均增加,其中室下區(qū)神經(jīng)干細(xì)胞比例增加而分化后細(xì)胞比例降低;對嗅球和海馬神經(jīng)元的檢測結(jié)果顯示,嗅球和海馬干細(xì)胞和分化細(xì)胞都有一定比例增加。miR-30c下調(diào)后結(jié)果與上述相反。進(jìn)一步的行為學(xué)檢測結(jié)果顯示,室下區(qū)miR-30c下調(diào)后,其嗅覺靈敏度明顯降低(
17、p<0.05);海馬齒狀回處miR-30c下調(diào)后,其條件恐懼記憶及空間記憶能力也均明顯下降(p值范圍分別為:p<0.05;p<0.01)。而上述對應(yīng)的miR-30c上調(diào)組和對照組相比其行為學(xué)上無明顯差異。以上結(jié)果表明,miR-30c水平的變化,可以影響成年新生神經(jīng)元的再生,并且一定數(shù)量的成年新生神經(jīng)元有利于增強(qiáng)嗅覺靈敏度和改善海馬的條件和空間記憶能力。
結(jié)論:
基于以上研究,我們的結(jié)果首次揭示:1)miR-30c可以
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