基于假基因的膠質瘤分子標記和分子分型研究.pdf

1、本文主要從以下幾方面進行論述：
　　第一部分 腦膠質瘤預后相關的假基因分子標記研究
　　目的：假基因被認為是一個潛在的抑癌基因或癌基因，并在許多疾病發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮作用，但其在膠質瘤中扮演的角色目前尚未被探明。的研究旨在尋找與膠質瘤預后相關的假基因標記。
　　方法：選擇中國人腦膠質瘤基因組學數(shù)據(jù)庫(CGGA)中的183例樣本的全基因組表達譜芯片數(shù)據(jù)，使用生物信息學的分析方法，分析并得到一組與腦膠質瘤預后密切相關的假基因。

2、
　　結果：將CGGA數(shù)據(jù)庫作為試驗分析庫，將腦腫瘤分子數(shù)據(jù)庫(REpository for Molecular BRAin Neoplasia DaTa，REMBRANDT)作為驗證數(shù)據(jù)庫。發(fā)現(xiàn)了一組共6個具有膠質瘤預后預測價值的假基因，以此為基礎建立了風險值估算公式，其風險值與膠質瘤預后密切相關(p＜0.001)。隨后，將這一發(fā)現(xiàn)在REMBRANDT數(shù)據(jù)庫中進行了驗證，并依據(jù)同樣的公式可以將樣本分為高風險組和低風險組，高風險組

3、預后明顯差于低風險組(p＜0.001)，且差別具有統(tǒng)計學意義。
　　結論：發(fā)現(xiàn)的這一組6個假基因所組成的預后相關假基因標記與膠質瘤患者的預后密切相關，盡管這一組6個假基因各自的功能尚未被發(fā)現(xiàn)，的這一發(fā)現(xiàn)提示了假基因在膠質瘤發(fā)病發(fā)展過程中潛在的作用，并提示假基因可能是潛在的膠質瘤治療靶點。
　　第二部分 假基因ANXA2P2與膠質瘤的惡性演進和預后相關
　　目的：針對膠質瘤的傳統(tǒng)診斷和治療方法效果不佳，分子診斷和分子靶向

4、治療有賴于更多更精準的分子標記和靶點的發(fā)現(xiàn)，假基因被認為可以作為致癌基因或抑癌基因存在，并在轉錄后調控發(fā)揮作用。旨在發(fā)現(xiàn)與膠質瘤惡性演變和預后相關的假基因分子標記，以期在未來服務于臨床治療。
　　方法：通過對REMBRANDT數(shù)據(jù)庫的一系列分析，發(fā)現(xiàn)了一個與膠質瘤惡性程度以及膠質瘤病人預后（生存期）密切相關的假基因，并將其在GSE4290數(shù)據(jù)庫中進一步驗證。
　　結果：發(fā)現(xiàn)在REMBRANDT數(shù)據(jù)庫中，隨著膠質瘤惡性程度增高

5、，ANXA2P2的表達逐漸增高，而高表達組較低表達組有著更差的預后，且其表達與ANXA2表達呈正相關，后者作為重要的膜連蛋白參與很多癌癥的進展;而后，在GSE4290數(shù)據(jù)庫中驗證了發(fā)現(xiàn)。
　　結論：ANXA2P2假基因與膠質瘤的惡性演變和預后密切相關，ANXA2P2還可能參與了BACH1介導下的轉錄后調控，可以作為一個值得注意的膠質瘤預后獨立預測因子以及膠質瘤惡性度評判標記。
　　第三部分 假基因HLA-DRB6與膠質瘤的惡

6、性演變和預后相關
　　目的：膠質瘤惡性程度高，傳統(tǒng)治療手段效果欠佳，分子靶向治療和免疫治療仍在進一步臨床試驗中，分子靶向治療和免疫治療需要更多的靶基因的發(fā)現(xiàn)，旨在尋找并發(fā)現(xiàn)更多特異性的分子標記，以期能夠為將來的治療手段打下基礎。
　　方法：利用目前假基因數(shù)據(jù)庫的不重疊性，使用生物信息學的方法在GSE4290數(shù)據(jù)庫中挑選出目標基因，并進一步在REMBRANDT數(shù)據(jù)庫中進行驗證。
　　結果：發(fā)現(xiàn)在GSE4290數(shù)據(jù)庫中，假

7、基因HLA-DRB6與膠質瘤惡性程度以及預后密切相關，隨著膠質瘤惡性程度升高，假基因HLA-DRB6表達值也升高;而高表達組較低表達組有著更差的預后，這些具有統(tǒng)計學意義;而后在REMBRANDT數(shù)據(jù)庫中的驗證可以得到同樣的結論。
　　結論：HLA-DRB6假基因在預測膠質瘤惡性程度和膠質瘤病人預后方面有一定價值，其作為人白細胞抗原超家族的一員可能在機體特異性免疫方面扮演重要角色，是一個潛在的免疫治療的靶標，但是依舊需要更多的實驗來

8、證實。
　　第四部分 基于假基因表達譜芯片對國人原發(fā)性腦膠質母細胞瘤的分子分型研究
　　目的：分子分型已被認為在多種癌癥的靶向及個體化治療中有重要作用。目前大多數(shù)分子分型是針對全部膠質母細胞瘤或膠質瘤，只有極少數(shù)針對原發(fā)性膠質母細胞瘤，旨在通過假基因表達譜來對原發(fā)性膠質母細胞瘤進行分子分型的研究。
　　方法：本研究共納入85例臨床證實的原發(fā)性膠質母細胞瘤，采用基因芯片的方法對其中的假基因數(shù)據(jù)進行提取及分析，提取出假基因

9、標記后對試驗組進行分型，并結合其他分型方法和基因標記進行研究，最后將所有的研究結果在REMBRANDT中驗證。
　　結果：發(fā)現(xiàn)一組6個假基因標記可以將85例原發(fā)性膠質母細胞瘤分為2個亞型，P1亞型和P2亞型，其中P1亞型相對高表達EGFR，并存在更多的MGMT啟動子甲基化率，而IDH1突變率較低;而P2亞型則與之相反。P1亞型較P2亞型有著更好的預后，在REMBRANDT中的驗證得到了同樣的結果。
　　結論：分型方法可以穩(wěn)定