木薯塊根基因表達譜分析.pdf

1、木薯是世界六億人賴于生存的主要食物來源，木薯制取燃料乙醇，既有廣闊的市場前景，又是解決我國能源安全的一條重要途徑。 本文利用華南124木薯，塊根膨大期的塊根總RNA構建了cDNA文庫，制備了125張cDNA微陣列，利用表達序列標簽、cDNA微陣列雜交，分析了木薯塊根基因表達的情況。文庫中得到了2878條序列，對2878個基因進行基本的分析、序列的比對、功能注釋、分析了表達基因的豐度、基因注釋的情況、基因功能分類的情形；并進行

2、了木薯苗期、塊根形成期、塊根膨大期、工藝成熟期四個生育時期共12個組織探針的雜交，得到木薯四個生育時期基因表達的情況。使用生物信息學軟件，分析了基因的差異表達的變化；使用T檢驗、K－mean聚類來分析塊根表達譜，分析了不同時期塊根中特異差異表達的基因，差異表達的基因以及塊根膨大期的根、莖、葉、塊根組織的特異差異表達基因的情況。分析表達說明，在塊根中差異上調(diào)的基因多于差異下調(diào)的基因。在塊根膨大期中，根、莖、葉三個組織的特異差異基因呈現(xiàn)規(guī)律

3、的變化，根的特異差異上調(diào)的基因最多，葉的特異差異上調(diào)基因最少，莖的特異差異上調(diào)與下調(diào)的基因數(shù)相差不大。反之，在根中特異差異下調(diào)的基因最少，葉中特異差異下調(diào)基因最多。塊根的基因表達和木薯塊根的形成、膨大、成熟等生理過程吻合，同時，也展示了木薯塊根的生長發(fā)育中復雜的生理生化活動的遺傳基礎。 本研究獲得了1708條新的基因，構建了木薯塊根的單一cDNA文庫，揭示了木薯生理生化變化的遺傳基礎，為重要基因的功能驗證打下基礎；為轉基因木薯