木薯塊根基因表達(dá)譜分析.pdf

1、木薯是世界六億人賴于生存的主要食物來(lái)源，木薯制取燃料乙醇，既有廣闊的市場(chǎng)前景，又是解決我國(guó)能源安全的一條重要途徑。 本文利用華南124木薯，塊根膨大期的塊根總RNA構(gòu)建了cDNA文庫(kù)，制備了125張cDNA微陣列，利用表達(dá)序列標(biāo)簽、cDNA微陣列雜交，分析了木薯塊根基因表達(dá)的情況。文庫(kù)中得到了2878條序列，對(duì)2878個(gè)基因進(jìn)行基本的分析、序列的比對(duì)、功能注釋、分析了表達(dá)基因的豐度、基因注釋的情況、基因功能分類(lèi)的情形；并進(jìn)行

2、了木薯苗期、塊根形成期、塊根膨大期、工藝成熟期四個(gè)生育時(shí)期共12個(gè)組織探針的雜交，得到木薯四個(gè)生育時(shí)期基因表達(dá)的情況。使用生物信息學(xué)軟件，分析了基因的差異表達(dá)的變化；使用T檢驗(yàn)、K－mean聚類(lèi)來(lái)分析塊根表達(dá)譜，分析了不同時(shí)期塊根中特異差異表達(dá)的基因，差異表達(dá)的基因以及塊根膨大期的根、莖、葉、塊根組織的特異差異表達(dá)基因的情況。分析表達(dá)說(shuō)明，在塊根中差異上調(diào)的基因多于差異下調(diào)的基因。在塊根膨大期中，根、莖、葉三個(gè)組織的特異差異基因呈現(xiàn)規(guī)律

3、的變化，根的特異差異上調(diào)的基因最多，葉的特異差異上調(diào)基因最少，莖的特異差異上調(diào)與下調(diào)的基因數(shù)相差不大。反之，在根中特異差異下調(diào)的基因最少，葉中特異差異下調(diào)基因最多。塊根的基因表達(dá)和木薯塊根的形成、膨大、成熟等生理過(guò)程吻合，同時(shí)，也展示了木薯塊根的生長(zhǎng)發(fā)育中復(fù)雜的生理生化活動(dòng)的遺傳基礎(chǔ)。 本研究獲得了1708條新的基因，構(gòu)建了木薯塊根的單一cDNA文庫(kù)，揭示了木薯生理生化變化的遺傳基礎(chǔ)，為重要基因的功能驗(yàn)證打下基礎(chǔ)；為轉(zhuǎn)基因木薯