腸炎沙門氏菌感染引起的白來航蛋雞脾臟全基因組表達譜分析.pdf

1、沙門氏菌屬腸桿菌科，為革蘭氏染色陰性桿菌，對蛋雞生產(chǎn)和食品安全造成重大影響。蛋雞沙門氏菌病主要是由沙門氏菌引起的一種以蛋雞出現(xiàn)零星死亡，產(chǎn)蛋率下降的慢性消耗疾病，時間一長，容易引起蛋雞消化道功能紊亂，雞群抗病力下降，繼發(fā)感染其它疾病。一些沙門氏菌含有攜帶耐藥因子的遺傳質(zhì)粒，耐藥因子傳遞的對多種抗生素的耐藥性，給治療沙門氏菌污染造成困難。從雞本身出發(fā)，研究其對沙門氏菌感染抗性的分子機制是緩解沙門氏菌病對蛋雞生產(chǎn)危害的有效途徑之一。

2、　　 本研究以開產(chǎn)蛋雞為研究對象，用腸炎沙門氏菌感染后，采集血液，用全血自動分析儀分析腸炎沙門氏菌對血液生理指標的影響，利用Agilent雞4*44K V2全基因組表達芯片檢測感染后8天和16天脾臟組織的基因表達，篩選出由沙門氏菌感染引起表達差異的基因，并對篩選出來的差異表達基因進行聚類分析，同時利用DAVID數(shù)據(jù)庫對其進行生物學功能分析。此外，我們利用QRT-PCR方法對芯片結(jié)果做了驗證，同時把篩選出來的差異表達基因與免疫相關(guān)基岡進

3、行關(guān)聯(lián)分析。并把兩個時間點篩選出來的差異基因進行了對比。結(jié)果顯示:
　　 (1)對照組和試驗組的血液樣品中白細胞的數(shù)量都普遍高于正常值，但同一時間點試驗組和對照組的比較差異不顯著;感染后8天的試驗組紅細胞數(shù)量明顯高于對照組，但在感染后16天這種差異未達到顯著性水平。
　　 (2)為了驗證芯片結(jié)果的可靠性，選擇了11個差異表達基因進行QRT-PCR。對芯片數(shù)據(jù)和QRT-PCR的結(jié)果進行了相關(guān)性分析，得出相關(guān)系數(shù)為r=0.8

4、04。 QRT-PCR驗證結(jié)果與芯片試驗結(jié)果一致，所以本研究所獲得的芯片結(jié)果是準確可靠的。
　　 (3)成功篩選出感染后8天脾臟樣品中差異表達基因1371個，包括已知的和免疫相關(guān)的基因33個;感染后16天脾臟樣品差異表達基因692個，其中和免疫相關(guān)的基因28個。
　　 (4)聚類分析結(jié)果顯示同一時間點試驗動物具有更相似的表達模式;部分和免疫相關(guān)的基因存在相似的調(diào)節(jié)功能，在聚類分析中聚在一塊。
　　 (5) GO和