APOB、LIPC、LDLR和LPA基因多態(tài)性與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、目的:研究脂質(zhì)消化、動(dòng)員和轉(zhuǎn)運(yùn)通路(lipid digestion，mobilization andtransport pathway)上的APOB基因rs679899、LIPC基因rs6078和rs6083、LDLR基因rs3826810、LPA基因rs3798220基因多態(tài)性與廣西地區(qū)人群中2型糖尿病的關(guān)聯(lián)性。
　　方法:采用病例對(duì)照的研究方法，929例2型糖尿病患者和1044例健康對(duì)照作為研究對(duì)象。采集研究對(duì)象的外周靜脈血，

2、利用試劑盒法提取DNA，應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(MALDI-TOF-MS)對(duì)5個(gè)SNPs(rs679899、rs6078、rs6083、rs3826810、rs3798220)進(jìn)行基因分型。本研究中成組t檢驗(yàn)和F檢驗(yàn)用于計(jì)量資料的比較，x2檢驗(yàn)用于計(jì)數(shù)資料的比較;采用plink軟件分析hardy-weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)、SNPs等位位點(diǎn)頻率及基因型分布;使用haploview4.2軟件分析連鎖不平衡檢驗(yàn)(LD)和

3、單倍體分析;多因子降維法(MDR)被用于不同SNPs之間交互作用模型的構(gòu)建;二分類非條件logistic回歸分析被用于基因-環(huán)境交互作用的分析。以上全部檢驗(yàn)均采用雙側(cè)檢驗(yàn)，檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。
　　結(jié)果:
　　(1)一般人口學(xué)特征:經(jīng)plink軟件計(jì)算，剔除76例樣本，最終，本次研究納入2型糖尿病病例890例，對(duì)照組1007例，病例組的平均年齡64.79±10.03歲，對(duì)照組的平均年齡64.02±9.49歲。病例組和對(duì)照組

4、在飲酒情況、BMI、TC、TG、HDL方面的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　(2)不同SNPs與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)分析:所研究的5個(gè)SNPs的基因頻率在對(duì)照組的分布符合hardy-weinberg平衡定律。在病例組和對(duì)照組間，APOB基因的rs679899位點(diǎn)的等位位點(diǎn)分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;在女性人群中，LPA基因rs3798220位點(diǎn)在共顯性模型中，CC基因型和TT基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;在隱性模型中，TT+CT

5、基因型和CC基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　(3)交互作用分析:采用MDR軟件分析，發(fā)現(xiàn)rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四個(gè)位點(diǎn)組成的模型，可能存在基因-基因交互作用?；?環(huán)境交互作用采用構(gòu)建二分類logistic回歸模型的方法，未發(fā)現(xiàn)基因-環(huán)境間存在交互作用。
　　(4)單體型分析:應(yīng)用haploview4.2軟件進(jìn)行單體型分析，并未發(fā)現(xiàn)分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的單體型。

6、>　　(5)不同SNPs與血清中脂質(zhì)代謝指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析:在病例組中，LIPC基因rs6078位點(diǎn)基因多態(tài)性與血清中LDL、HDL、TC水平有關(guān)，LIPC基因rs6083位點(diǎn)基因多態(tài)性與血清中TC水平有關(guān)，LPA基因rs3798220位點(diǎn)基因多態(tài)性與血清中TG水平有關(guān);在對(duì)照組中，LIPC基因上rs6083位點(diǎn)基因多態(tài)性與血清中TC水平有關(guān)。
　　結(jié)論:
　　(1)在女性人群中，LPA基因上rs3798220位點(diǎn)的CC基因型可

7、能是2型糖尿病的易感基因型。
　　(2) rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四個(gè)位點(diǎn)可能存在基因-基因交互作用。
　　(3)在LIPC基因rs6078上，攜帶GA基因型可能與T2DM患者血清中LDL、HDL、TC高表達(dá)有關(guān)聯(lián);攜帶A等位位點(diǎn)可能與T2DM患者血清中HDL和TC高表達(dá)有關(guān)。
　　(4)在LIPC基因rs6083上，攜帶AA基因型可能與T2DM患者血清中TC升高有關(guān)。