廣西某市屠宰豬淋巴結(jié)PCV2和PCV3的病原檢測及遺傳進(jìn)化分析.pdf

1、圓環(huán)病毒(Porcine circovirus PCV)在國內(nèi)外養(yǎng)豬業(yè)存在普遍感染的情況，自發(fā)現(xiàn)以來圓環(huán)病毒的感染對世界各國養(yǎng)豬業(yè)都造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。它可以侵襲豬體內(nèi)的淋巴系統(tǒng)，使淋巴細(xì)胞有一定程度的減少，豬體免疫力下降，從而導(dǎo)致豬群無法健康成長。屠宰場是安全豬肉提供的重要場所，負(fù)責(zé)對生豬進(jìn)行最后的處理，所以需要對其進(jìn)行嚴(yán)格的病原檢測，以防止病原進(jìn)一步的傳播。
　　本研究主要采集2017年6月～2017年8月廣西某市屠宰場18

2、1份淋巴結(jié)，進(jìn)行PCV2與PCV3的病原檢測，以此分析健康屠宰豬中圓環(huán)病毒攜帶情況。結(jié)果表明，在181份樣品中，PCV2陽性份數(shù)是108，陽性率為59.67％;PCV3陽性份數(shù)是44，陽性率為24.31％;PCV2及PCV3混合感染份數(shù)是27，混合感染率為14.92％。這說明在健康屠宰豬群中圓環(huán)病毒的感染率較高，帶毒情況較為嚴(yán)重。
　　本研究成功獲得5條PCV2全序列(1767bp)，并根據(jù)序列分別對其進(jìn)行了系統(tǒng)分析和構(gòu)建遺傳進(jìn)化

3、樹。結(jié)果表明，5條PCV2全序列之間核苷酸同源性為96.1％-99.5％，5株ORF2的核苷酸同源性為94.0％-99.7％，5株氨基酸的同源性為94.0％-100.0％。通過與近年來廣西境內(nèi)的PCV2毒株及國內(nèi)外PCV2毒株比較分析發(fā)現(xiàn)，廣西主要流行PCV2b型，而其中PCV2b-1C亞群是優(yōu)勢毒株。
　　本研究獲得6條PCV3全序列(2000bp)，并根據(jù)序列分別對其進(jìn)行了系統(tǒng)分析和構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹。結(jié)果表明，6株P(guān)CV3毒株全

4、序列之間核苷酸同源性為98.6％～99.4％，ORF2基因之間的核苷酸同源性為97.2％-99.8％。而國內(nèi)外現(xiàn)有的PCV3全基因的同源性為98.6％-99.9％，現(xiàn)有的PCV3ORF2基因的同源性為97.2％-99.4％。說明目前世界各地的PCV3全基因序列同源性都較高，變異程度較低。通過遺傳進(jìn)化樹來看，目前的PCV3毒株可以分為兩大亞型，且這6條毒株在兩個(gè)亞型中都有分布。
　　此外還將PCVs的ORF2基因及其Cap蛋白進(jìn)行了

5、比較分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)PCV1、PCV2和PCV3親緣性都比較遠(yuǎn)，雖然PCV1和PCV2都在同大一分支上，但是在分支中距離相差很遠(yuǎn)。PCV3在另外一個(gè)大分支上，且明顯與其他兩個(gè)型距離更遠(yuǎn)。PCV2Cap蛋白與PCV3Cap蛋白之間的同源性僅為26.5％-29.9％。通過比較PCVs Cap蛋白的同源性及對PCVs Cap蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比對分析，認(rèn)為PCV2與PCV3不具有交叉保護(hù)性。
　　本研究對廣西健康屠宰豬的PCV2和PCV