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文檔簡介
1、圓環(huán)病毒(Porcine circovirus PCV)在國內(nèi)外養(yǎng)豬業(yè)存在普遍感染的情況,自發(fā)現(xiàn)以來圓環(huán)病毒的感染對(duì)世界各國養(yǎng)豬業(yè)都造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。它可以侵襲豬體內(nèi)的淋巴系統(tǒng),使淋巴細(xì)胞有一定程度的減少,豬體免疫力下降,從而導(dǎo)致豬群無法健康成長。屠宰場是安全豬肉提供的重要場所,負(fù)責(zé)對(duì)生豬進(jìn)行最后的處理,所以需要對(duì)其進(jìn)行嚴(yán)格的病原檢測,以防止病原進(jìn)一步的傳播。
本研究主要采集2017年6月~2017年8月廣西某市屠宰場18
2、1份淋巴結(jié),進(jìn)行PCV2與PCV3的病原檢測,以此分析健康屠宰豬中圓環(huán)病毒攜帶情況。結(jié)果表明,在181份樣品中,PCV2陽性份數(shù)是108,陽性率為59.67%;PCV3陽性份數(shù)是44,陽性率為24.31%;PCV2及PCV3混合感染份數(shù)是27,混合感染率為14.92%。這說明在健康屠宰豬群中圓環(huán)病毒的感染率較高,帶毒情況較為嚴(yán)重。
本研究成功獲得5條PCV2全序列(1767bp),并根據(jù)序列分別對(duì)其進(jìn)行了系統(tǒng)分析和構(gòu)建遺傳進(jìn)化
3、樹。結(jié)果表明,5條PCV2全序列之間核苷酸同源性為96.1%-99.5%,5株ORF2的核苷酸同源性為94.0%-99.7%,5株氨基酸的同源性為94.0%-100.0%。通過與近年來廣西境內(nèi)的PCV2毒株及國內(nèi)外PCV2毒株比較分析發(fā)現(xiàn),廣西主要流行PCV2b型,而其中PCV2b-1C亞群是優(yōu)勢(shì)毒株。
本研究獲得6條PCV3全序列(2000bp),并根據(jù)序列分別對(duì)其進(jìn)行了系統(tǒng)分析和構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹。結(jié)果表明,6株P(guān)CV3毒株全
4、序列之間核苷酸同源性為98.6%~99.4%,ORF2基因之間的核苷酸同源性為97.2%-99.8%。而國內(nèi)外現(xiàn)有的PCV3全基因的同源性為98.6%-99.9%,現(xiàn)有的PCV3ORF2基因的同源性為97.2%-99.4%。說明目前世界各地的PCV3全基因序列同源性都較高,變異程度較低。通過遺傳進(jìn)化樹來看,目前的PCV3毒株可以分為兩大亞型,且這6條毒株在兩個(gè)亞型中都有分布。
此外還將PCVs的ORF2基因及其Cap蛋白進(jìn)行了
5、比較分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)PCV1、PCV2和PCV3親緣性都比較遠(yuǎn),雖然PCV1和PCV2都在同大一分支上,但是在分支中距離相差很遠(yuǎn)。PCV3在另外一個(gè)大分支上,且明顯與其他兩個(gè)型距離更遠(yuǎn)。PCV2Cap蛋白與PCV3Cap蛋白之間的同源性僅為26.5%-29.9%。通過比較PCVs Cap蛋白的同源性及對(duì)PCVs Cap蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,認(rèn)為PCV2與PCV3不具有交叉保護(hù)性。
本研究對(duì)廣西健康屠宰豬的PCV2和PCV
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